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Enregistrement W2897154867 · doi:10.1111/pce.13463

Lectin AtGAL1 interacts with high‐mannose glycoform of the purple acid phosphatase AtPAP26 secreted by phosphate‐starved <i>Arabidopsis</i>

2018· article· en· W2897154867 sur OpenAlexafffund
Mina Ghahremani, Joonho Park, Erin M. Anderson, Naomi J. Marty‐Howard, Robert T. Mullen, William C. Plaxton

Notice bibliographique

RevuePlant Cell & Environment · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensUniversity of GuelphQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMannoseBiochemistryBimolecular fluorescence complementationArabidopsisPhosphataseLectinComplementationProtein-fragment complementation assayGlycosylationArabidopsis thalianaMannose 6-phosphateEnzymeAcid phosphataseBiologyChemistryMolecular biologyGeneReceptorMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Among 29 predicted Arabidopsis purple acid phosphatases (PAPs), AtPAP26 functions as the principle extracellular and intracellular PAP isozyme that is upregulated to recycle and scavenge Pi during Pi‐deprivation or leaf senescence. Our companion paper documented the copurification of a secreted, high‐mannose AtPAP26‐S2 glycoform with AtGAL1 (At1g78850), a Pi starvation‐inducible (PSI), and Galanthus nivalis agglutinin‐related (mannose‐binding) and apple domain lectin. This study tests the hypothesis that AtGAL1 binds AtPAP26‐S2 to modify its enzymatic properties. Far‐western immunodot blotting established that AtGAL1 readily associates with AtPAP26‐S2 but not the low mannose AtPAP26‐S1 glycoform nor other secreted PSI PAPs (i.e., AtPAP12 or AtPAP25). Analytical gel filtration indicated that 55‐kDa AtGAL1 and AtPAP26‐S2 polypeptides associate to form a 112‐kDa heterodimer. Microscopic imaging of transiently expressed, fluorescent protein‐tagged AtGAL1, and associated bimolecular fluorescence complementation assays demonstrated that (a) like AtPAP26, AtGAL1 also localizes to lytic vacuoles of Pi‐deprived Arabidopsis and (b) both proteins interact in vivo. AtGAL1 preincubation significantly enhanced the acid phosphatase activity and thermal stability of AtPAP26‐S2 but not AtPAP26‐S1. We hypothesize that AtGAL1 plays an important role during Pi deprivation through its interaction with mannose‐rich glycans of AtPAP26‐S2 and consequent positive impact on AtPAP26‐S2 activity and stability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,418
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,156
Écart entre enseignants0,150 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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