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Enregistrement W2898112221 · doi:10.1016/j.imu.2018.10.009

Human Blastocyst's Zona Pellucida segmentation via boosting ensemble of complementary learning

2018· article· en· W2898112221 sur OpenAlexaff
Reza Moradi Rad, Parvaneh Saeedi, Jason Au, Jon Havelock

Notice bibliographique

RevueInformatics in Medicine Unlocked · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensCanadian Hemophilia SocietyPacific Centre for Reproductive MedicineSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésJaccard indexZona pellucidaBlastocystComputer scienceArtificial intelligencePattern recognition (psychology)SegmentationBoosting (machine learning)Artificial neural networkMachine learningEmbryoBiologyOocyteEmbryogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Characteristics of Zona Pellucida (ZP), particularly its thickness, is a key indicator of human blastocyst (day-5 embryo) quality. Therefore, ZP segmentation is an important step towards achieving automatic embryo quality assessment. In this paper, a novel approach based on boosting ensemble of hybrid complementary learning is proposed to segment Zona Pellucida in human blastocyst images. First, an inner-ZP localization method is proposed to separate the ZP from the heavily textured area inside a blastocyst. Then, a deep Hierarchical Neural Network (HiNN) is proposed to segment ZP area. The hierarchical nature of the proposed network enables learning features with respect to their spatial location in the embryo. Finally, a Self-supervised Image-Specific Refinement (SISR) strategy is proposed as a complementary step to boost the performance. The proposed system is a hybrid approach in the sense that the HiNN learns the intra-correlation among images, while the SISR takes into account the inter-correlation within the query image. Experimental results confirm that the proposed method is capable of identifying ZP area with average Precision, Recall, Accuracy and Jaccard Index of 85.2%, 92.0%, 95.6% and 78.1%, respectively. The proposed HiNN system outperforms state of the art by 4.9% in Precision, 11.2% in Recall, 3.6% in Accuracy and 10.7% in Jaccard Index.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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