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Enregistrement W2898182858 · doi:10.1139/gen-2018-0106

Functional characterization of a reproductive tissue specific promoter from <i>Eucalyptus camaldulensis</i>

2018· article· en· W2898182858 sur OpenAlexvenueno aff
Boby Vattekkattu Unnikrishnan, Gurumurthy Demlapura Shankaranarayana

Notice bibliographique

RevueGenome · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Delhi
Mots-clésBiologyGenePollenTransgeneGene expressionPromoterGenetically modified cropsGeneticsMolecular biologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SWEET proteins are essential for the maintenance of nectar production, as well as seed and pollen development, in plants. A search within the Eucalyptus genome identified 52 putative genes belonging to the SWEET gene family based on sequence similarity. The expression of two of these genes, EcSWEET2 and EcSWEET5, was analyzed in vegetative and reproductive tissues of Eucalyptus camaldulensis. The expression of EcSWEET5 was specific to male reproductive tissues, and transcripts were detected only at certain stages of flower development. Tobacco Rattle Virus (TRV)-mediated suppression of EcSWEET5 resulted in a significant reduction in pollen germination percentage in Nicotiana benthamiana without adverse effect on vegetative growth. A promoter sequence 1 kb upstream of the start codon of EcSWEET5 contained many elements suggestive of pollen specificity of the promoter. This specificity was confirmed in transgenic tobacco lines harboring a GUS gene whose expression was controlled by the EcSWEET5 gene promoter. GUS expression was limited to pollen alone in transgenic tobacco as evidenced by histochemical staining. The expression of a cytotoxic gene, barnase under the control of the EcSWEET5 gene promoter, showed pollen ablation in transgenic tobacco with normal vegetative growth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,302
Score d'incertitude au seuil0,512

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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