MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2898329374 · doi:10.3389/fmicb.2018.02537

Vibrio natriegens as Host for Expression of Multisubunit Membrane Protein Complexes

2018· article· en· W2898329374 sur OpenAlexaff
Lena Schleicher, Valentin Muras, Björn Claußen, Jens Pfannstiel, Bastian Blombach, Pavel Dibrov, G. Fritz, Julia Steuber

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésHost (biology)BiologyMicrobiologyBacteriaProtein expressionVibrioVibrio choleraeCell biologyChemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

E. coli is a convenient host for the expression of proteins, but the heterologous production of large membrane protein complexes often is hampered by the lack of specific accessory genes required for membrane insertion or cofactor assembly. In this study we introduce the nonpathogenic and fast-growing Vibrio natriegens as a suitable expression host for membrane-bound proteins from V. cholerae. We achieved production of the primary Na+ pump, the NADH:quinone oxidoreductase (NQR), from V. cholerae in an active state, as indicated by increased overall NADH:quinone oxidoreduction activity of membranes from the transformed V. natriegens, and the sensitivity towards Ag+, a specific inhibitor of the NQR. Complete assembly of V. cholerae NQR expressed in V. natriegens was demonstrated by BN PAGE followed by activity staining. The secondary transport system Mrp from V. cholerae, another membrane-bound multisubunit complex, was also produced in V. natriegens in a functional state, as demonstrated by in vivo Li+ transport. V. natriegens is a promising expression host for the production of membrane protein complexes from Gram-negative pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in MicrobiologyMême sujetVibrio bacteria research studiesTravaux en français237 207