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Enregistrement W2899451374 · doi:10.1016/j.celrep.2018.10.021

Integrated Stress Response Activity Marks Stem Cells in Normal Hematopoiesis and Leukemia

2018· article· en· W2899451374 sur OpenAlexafffund
Peter van Galen, Nathan Mbong, Antonia Kreso, Erwin M. Schoof, Elvin Wagenblast, Stanley Ng, Gabriela Krivdova, Liqing Jin, Hiromitsu Nakauchi, John E. Dick

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchEMBOCanadian Cancer Society Research InstituteTerry Fox FoundationOntario GenomicsCanada Research ChairsEuropean CommissionOntario Ministry of Health and Long-Term CareOntario Genomics InstitutePrincess Margaret Hospital FoundationLeukemia and Lymphoma SocietyGenome CanadaHospital for Sick ChildrenHuman Frontier Science ProgramOntario Institute for Cancer ResearchEuropean Molecular Biology Organization
Mots-clésHaematopoiesisStem cellLeukemiaCell biologyBiologyFight-or-flight responseCancer researchImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lifelong maintenance of the blood system requires equilibrium between clearance of damaged hematopoietic stem cells (HSCs) and long-term survival of the HSC pool. Severe perturbations of cellular homeostasis result in rapid HSC loss to maintain clonal purity. However, normal homeostatic processes can also generate lower-level stress; how HSCs survive these conditions remains unknown. Here we show that the integrated stress response (ISR) is uniquely active in HSCs and facilitates their persistence. Activating transcription factor 4 (ATF4) mediates the ISR and is highly expressed in HSCs due to scarcity of the eIF2 translation initiation complex. Amino acid deprivation results in eIF2α phosphorylation-dependent upregulation of ATF4, promoting HSC survival. Primitive acute myeloid leukemia (AML) cells also display eIF2 scarcity and ISR activity marks leukemia stem cells (LSCs) in primary AML samples. These findings identify a link between the ISR and stem cell survival in the normal and leukemic contexts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations135
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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