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Enregistrement W2899619720 · doi:10.1093/neuonc/noy148.1076

TMIC-17. IMMUNE MICROENVIRONMENT OF NF2-ALTERED RADIATION-INDUCED MENINGIOMAS

2018· article· en· W2899619720 sur OpenAlexaff
Suganth Suppiah, Shirin Karimi, Yasin Mamatjan, Farshad Nassiri, Kenneth Aldape, Gelareh Zadeh

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMeningioma and schwannoma management
Établissements canadiensUniversity of TorontoToronto Western HospitalPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunohistochemistryImmune systemTumor microenvironmentRadiation therapyCancer researchPathologyMedicineExome sequencingBiologyGenePhenotypeInternal medicineImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Radiation-induced meningiomas (RIMS) are more clinically aggressive than their sporadic counterparts, with higher rates of tumor recurrence, multiplicity and neurological impairment. Our laboratory has previously demonstrated that RIMs have a distinct genomic profile with a subset of tumors harboring NF2 inactivation through genomic rearrangements. In this study we establish the clinical characteristics and immune microenvironment between RIMs with and without the NF2 alterations. A retrospective chart review was performed on 31 RIMs. Volumetric analysis was performed using ITK-SNAP on serial preoperative imaging to estimate tumor growth rate. Immunohistochemistry staining for PD-1, PD-L1, CD-3, CD-163, and FOX-P3 were performed. Results were correlated with whole exome sequencing and RNA sequencing data previously published. Pathway analysis was performed using Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) on RNA sequencing data using the differentially expressed genes. Clinically, NF2-altered tumors and NF2-WT (wildtype) tumors did not differ based on age at diagnosis, indication for previous radiation, WHO grade, histopathological subtype, extent of resection and tumor location. NF2-altered tumors had a significantly faster growth rate compared to NF2-WT tumors (3.8X faster, p>0.05). The difference in growth rate was independent of tumor grade. PD-L1 staining was negative on tumor cells in NF2-altered tumors and patchy positivity in 60% of NF2-WT tumors (p < 0.05). In contrast, 100% and 60% of tumors had PD-L1 positive immune cells in NF2-altered and NF2-WT tumors, respectively (p<0.05). The degree of CD3+ lymphocyte infiltration was lower in NF2-altered tumors (t=2.73, p<0.05). Our findings suggest that there is a difference in the immune microenvironment between NF2-altered and NF2-WT RIMs. NF2-altered tumors have a lower degree of CD3+ lymphocyte infiltration and higher frequency of PD-L1 positive immune cells that are indicative of an immunosuppressed microenvironment. Further work is needed to elucidate pathways that may be targeted to manipulate the immune microenvironment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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