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Enregistrement W2899680415 · doi:10.1038/s41598-018-34891-w

Cyclosporine A binding to COX-2 reveals a novel signaling pathway that activates the IRE1α unfolded protein response sensor

2018· article· en· W2899680415 sur OpenAlexafffund
Jody Groenendyk, Tautvydas Paškevičius, Hery Urra, Clement Viricel, Kui Wang, Khaled Barakat, Lukasz Kurgan, Luis B. Agellon, Marek Michalak

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFondo de Financiamiento de Centros de Investigación en Áreas PrioritariasCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of Canada
Mots-clésUnfolded protein responseSignal transductionCell biologyEndoplasmic reticulumChemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cyclosporine, a widely used immunosuppressant in organ transplantation and in treatment of various autoimmune diseases, activates the unfolded protein response (UPR), an ER stress coping response. In this study we discovered a new and unanticipated cyclosporine-dependent signaling pathway, with cyclosporine triggering direct activation of the UPR. COX-2 binds to and activates IRE1α, leading to IRE1α splicing of XBP1 mRNA. Molecular interaction and modeling analyses identified a novel interaction site for cyclosporine with COX-2 which caused enhancement of COX-2 enzymatic activity required for activation of the IRE1α branch of the UPR. Cyclosporine-dependent activation of COX-2 and IRE1α in mice indicated that cyclosporine-COX-2-IRE1α signaling pathway was functional in vivo. These findings identify COX-2 as a new IRE1α binding partner and regulator of the IRE1α branch of the UPR pathway, and establishes the mechanism underlying cytotoxicity associated with chronic cyclosporine exposure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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