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Enregistrement W2899937575 · doi:10.1111/jcmm.13966

Gestational age‐dependent gene expression profiling of<scp>ATP</scp>‐binding cassette transporters in the healthy human placenta

2018· article· en· W2899937575 sur OpenAlexafffund
Güínever E. Império, Mohsen Javam, Phetcharawan Lye, Andrea Constantinof, Caroline Dunk, Fernando M. Reis, Stephen J. Lye, William Gibb, Stephen G. Matthews, Tânia Maria Ortiga-Carvalho, Enrrico Bloise

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular and Molecular Medicine · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of OttawaLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésATP-binding cassette transporterSyncytiotrophoblastBiologyAbcg2Solute carrier familyPlacentaWestern blotTransporterGene expression profilingAndrologyGene expressionFetusGenePregnancyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract TheATP‐binding cassette (ABC) transporters control placental transfer of several nutrients, steroids, immunological factors, chemicals, and drugs at the maternal‐fetal interface. We and others have demonstrated a gestational age‐dependent expression pattern of twoABCtransporters, P‐glycoprotein and breast cancer resistance protein throughout pregnancy. However, no reports have comprehensively elucidated the expression pattern of all 50ABCproteins, comparing first trimester and term human placentae. We hypothesized that placentalABCtransporters are expressed in a gestational‐age dependent manner in normal human pregnancy. Using the TaqMan®HumanABCTransporter Array, we assessed themRNAexpression of all 50ABCtransporters in first (first trimester, n = 8) and third trimester (term, n = 12) human placentae and validated the resulting expression of selectedABCtransporters usingqPCR, Western blot and immunohistochemistry. A distinct gene expression profile of 30ABCtransporters was observed comparing first trimestervs. term placentae. Using individualqPCRin selected genes, we validated the increased expression ofABCA1(P < 0.01),ABCA6(P < 0.001),ABCA9(P < 0.001) andABCC3(P < 0.001), as well as the decreased expression ofABCB11(P < 0.001) andABCG4(P < 0.01) with advancing gestation. One important lipid transporter,ABCA6, was selected to correlate protein abundance and characterize tissue localization.ABCA6 exhibited increased protein expression towards term and was predominantly localized to syncytiotrophoblast cells. In conclusion, expression patterns of placentalABCtransporters change as a function of gestational age. These changes are likely fundamental to a healthy pregnancy given the critical role that these transporters play in the regulation of steroidogenesis, immunological responses, and placental barrier function and integrity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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