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Enregistrement W2900038271

Inhibition of skeletal metastasis in prostate cancer growth by S-adenosylmethionine (SAM) and methyl binding domain protein 2 (MBD2) knockdown.

2007· article· en· W2900038271 sur OpenAlexaff
Nicholas Shukeir, Moshe Szyf, Shafaat A. Rabbani

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchGene knockdownMetastasisLNCaPProstate cancerBiologyTumor progressionGene silencingCancerCancer cellIntravasationCell cultureGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1167 During prostate cancer progression high levels of expression of growth factors and proteases play an important role in tumor growth, invasion and skeletal metastasis; often seen in patients with late stage hormone refractory prostate cancer (HRPC). Urokinase (uPA) plays an important role due to its ability to breakdown extracellular matrix to facilitate tumor invasion and metastasis. We hypothesized that global demethylation, a common epigenomic process, co-activates prometastatic genes in metastatic cancer. Studies carried out in our laboratory have shown the differential expression of uPA in human prostate cancer cells representing early (LnCAP) and late stage (PC-3) disease due to total demethylation of the uPA promoter in PC-3 cells. In the current study, we aim to evaluate the effect of changing the methylation status of the uPA promoter in PC-3 cells and its effect on tumor growth and skeletal metastasis. Towards these goals, PC-3 cells were treated with different doses of the universal methylating agent SAM or transfected with MBD2 antisense oligonucleotides (AS). The inactive homologue of SAM (SAH) and scrambled oligonucleotides (S) were used as control. Treatment of PC-3 cells with SAM or MBD2 knockdown resulted in a dose dependent inhibition in the levels of uPA mRNA expression resulting in a significant decrease in tumor cell invasive capacity. Additional genes involved in tumor progression including MMP-2 and VEGF were also downregulated. No change was observed in the levels of expression of genes known to be partially or fully methylated in HRPC such as GSTP1 and androgen receptor (AR). For in vivo studies, male Balb c nu/nu mice were inoculated with control and experimental cells via subcutaneous route or directly into tibia. Animals receiving cells treated with SAM and AS oligo developed tumors of significantly smaller volume (70%) compared to animals receiving untreated or S oligo transfected cells. In other studies, all animals inoculated with control cells into tibia developed skeletal lesions while animals injected with experimental cells either failed (90%) to develop or developed (10%) lesions of markedly smaller area as determined by X-ray using Faxitron, micro CT and bone histomormphometric analysis. Analysis of affiymetrix microarray of control, SAM and MBD2 treated PC-3 cells showed a significant reduction in the levels of expression of genes coding several factors and their receptors which are involved in tumor growth and skeletal metastasis. Change in the levels of expression of these genes was confirmed and the role of DNA methylation established by bisulfite sequencing. Results from these studies will elucidate the role of DNA demethyaltion in prostate cancer progression and its propensity to metastasize to skeleton which will help in developing new diagnostic, prognostic and therapeutic strategies for patients with HRPC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
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