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Enregistrement W2900083938 · doi:10.3389/fninf.2018.00077

The CAMH Neuroinformatics Platform: A Hospital-Focused Brain-CODE Implementation

2018· article· en· W2900083938 sur OpenAlex
David Rotenberg, Qing Chang, Natalia Potapova, Andy Wang, Marcia Hon, Marcos Sanches, Nikola Bogetic, Nathan Frias, Tommy Liu, Brendan Behan, Rachad El-Badrawi, Stephen C. Strother, Susan Gilbert Evans, Jordan Mikkelsen, Tom Gee, Fan Dong, Stephen R. Arnott, Shuai Laing, Moyez Dharsee, Anthony L. Vaccarino, Mojib Javadi, Kenneth Evans, Damian Jankowicz

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neuroinformatics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensIndoc ResearchUniversity of TorontoPublic Health OntarioBaycrest HospitalOntario Brain InstituteCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesCanada Foundation for InnovationGovernment of Ontario
Mots-clésNeuroinformaticsStandardizationComputer scienceContext (archaeology)Data scienceAnalytics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding the human brain in both healthy function and in the context of psychiatric illness presents a formidable technical and analytic challenge for medical researchers. Multi-modal data, including medical imaging, molecular and clinical measures provide lenses through which the brain’s structure, function, expression and behavioral presentation can be studied. While directed integration of complementary information promises to accelerate discovery and identify cross-modal biomarkers for stratification, diagnosis and treatment, such approaches, require stringent data standardization and are often computationally demanding, compounded by increased data volumes, statistical power and sample size requirements. To realize the potential of multi-modal data integration toward the study of mental illness, the Center for Addiction and Mental Health (CAMH) constructed a centralized data capture, visualization and analytics environment – the CAMH Neuroinformatics Platform – based on the Ontario Brain Institute (OBI) Brain-CODE platform, enabling the curation of a standardized, consolidated psychiatric hospital-wide research dataset, directly coupled to high performance computing resources.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,212
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle