CBMT-06. LOWER GRADE ISOCITRATE DEHYDROGENASE (IDH) MUTANT GLIOMAS METABOLICALLY MIMICKING GLIOBLASTOMA (GBM) EXPRESS HIGHER R:S 2-HYDROXYGLUTARATE RATIOS RELATIVE TO NON-GBM-MIMICKING IDH MUTANT GLIOMAS
Notice bibliographique
Résumé
Glioma patients continue to carry a very poor prognosis despite maximal therapy, urging for the development of novel therapies. Previous studies have identified mutations of metabolic enzymes directly regulating cellular metabolism, specifically, isocitrate dehydrogenase (IDH1/2) mutation. IDH1/2 mutations occur early in glioma pathogenesis and result in the accumulation of oncometabolite 2-hydroxylgutarate (2-HG), with the preferential accumulation of the R relative to the S enantiomer of 2-HG. This metabolic reprogramming may help explain treatment resistance and highlight potential metabolic pathways involved in tumorigenesis. To investigate the metabolic profile of a cohort of gliomas, we used ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry (UPLC-MS/MS) to detect a set of 689 metabolites in 90 IDH1 mutant and IDH1 wildtype gliomas. Unsupervised consensus clustering identified two distinct metabolic subgroups of gliomas: metabolic group 1, which consists of only IDH1 mutated tumors (n=30) and metabolic group 2, which consists of all IDH1 wildtype tumors and a subset of IDH1 mutated tumors (n=60). We therefore, termed these IDH1 mutated tumors in metabolic group 2 as “GBM mimickers”. Importantly, comparison of IDH mutant tumors from metabolic group 1 versus the GBM mimickers showed distinct R:S 2-HG ratio differences, specifically with the GBM mimickers expressing significantly higher R:S 2-HG ratios (mean R:S 2-HG 2421.44 vs. 625.46, p=0.014). Moreover, the GBM mimickers showed significantly decreased progression free survival (20 months vs. 49 months, p<0.05, respectively) and increased tumor enhancement on imaging versus their IDH1 mutated counterparts in metabolic group 1 (100% vs. 37.5%, p<0.0001), suggesting that R:S 2-HG ratio may be a marker of poor outcome. CONCLUSION: Our data supports distinct metabolic subtypes of IDH mutant gliomas, and highlights the use of R:S 2-HG ratio as a potential marker of poor outcome in IDH mutant gliomas.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».