A novel link between Cell Wall Integrity pathway and Flocculation, regulated by yeast Sen1 dependent interplay between Rlm1 and Tup1
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The budding yeast, Saccharomyces cerevisiae is one of the most studied organisms used for the synthesis of products, to explore the human diseases and eukaryotic gene expression mechanisms. The yeast cells with flocculation property are in high demand for industrial applications. However, the pathogenic yeast becomes drug-resistant due to flocculation/biofilm phenotype. The flocculation property of yeast depends on the expression of specific FLO genes. Genetic and epigenetic factors have been suggested to induce the expression of FLO s and flocculation, an evolutionarily conserved process. The present study was undertaken to identify a molecular link between stress caused by genetic and epigenetic factors and expression of FLO s. We utilized flocculating yeast strains to study the regulation of FLO genes and flocculation phenotype. We found rough surface morphology and constitutive activation of Slt2 in flocculating cells. The external cell wall stress factors as well as specific mutations in Sen1 and histone proteins strongly correlated with the induction of FLO genes whereas deletion of SLT2 / RLM1 , suppressed the expression and flocculation phenotype. We detected constitutive binding of Rlm1 and eviction of Tup1 from the promoters of FLO1 and FLO5 genes in flocculating cells. Thus we provide evidence for the CWI pathway dependent flocculation of yeast, regulated by Sen1 mediated interplay between Tup1 and Rlm1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».