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Enregistrement W2900595715 · doi:10.1371/journal.ppat.1007398

HIV-1 capsids from B27/B57+ elite controllers escape Mx2 but are targeted by TRIM5α, leading to the induction of an antiviral state

2018· article· en· W2900595715 sur OpenAlexafffund
Natacha Mérindol, Mohamed El‐Far, Mohamed Sylla, Nasser Masroori, Caroline Dufour, Jiaxin Li, Pearl Cherry, Mélodie B. Plourde, Cécile Tremblay, Lionel Berthoux

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de MontréalUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchMitacs
Mots-clésCytotoxic T cellViral replicationCapsidTetherinInnate immune systemViremiaCytosolBiologyVirologyVirusCell biologyImmune systemIn vitroImmunologyGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elite controllers (ECs) are a rare subset of HIV-1 slow progressors characterized by prolonged viremia suppression.HLA alleles B27 and B57 promote the cytotoxic T lymphocyte (CTL)-mediated depletion of infected cells in ECs, leading to the emergence of escape mutations in the viral capsid (CA).Whether those mutations modulate CA detection by innate sensors and effectors is poorly known.Here, we investigated the targeting of CA from B27/B57 + individuals by cytosolic antiviral factors Mx2 and TRIM5α.Toward that aim, we constructed chimeric HIV-1 vectors using CA isolated from B27/B57 + or control subjects.HIV-1 vectors containing B27/B57 + -specific CA had increased sensitivity to TRIM5α but not to Mx2.Following exposure to those vectors, cells showed increased resistance against both TRIM5α-sensitive and -insensitive HIV-1 strains.Induction of the antiviral state did not require productive infection by the TRIM5α-sensitive virus, as shown using chemically inactivated virions.Depletion experiments revealed that TAK1 and Ubc13 were essential to the TRIM5α-dependent antiviral state.Accordingly, induction of the antiviral state was accompanied by the activation of NF-κB and AP-1 in THP-1 cells.Secretion of IFN-I was involved in the antiviral state in THP-1 cells, as shown using a receptor blocking antibody.This work identifies innate activation pathways that are likely to play a role in the natural resistance to HIV-1 progression in ECs. Author summarySome HIV-1-infected individuals show a natural capacity to control viral propagation.In individuals that have the HLA B27 or B57 allele, HIV-1 control is associated with mutations in viral proteins that arise as a result of immune pressure from cytotoxic T lymphocytes.HIV-1 capsid protein mutations found in these subjects render HIV-1 more sensitive to detection by TRIM5α, a cytoplasmic innate effector that targets retroviral capsids.We show here that HIV-1 bearing such mutations is restricted by TRIM5α but not by Mx2,

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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