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Enregistrement W2901150882 · doi:10.1159/000494331

Variants in <b><i>APOA5</i></b> and <b><i>ADIPOQ</i></b> Moderate Improvements in Metabolic Syndrome during a One-Year Lifestyle Intervention

2018· article· en· W2901150882 sur OpenAlexafffundabout
Dana E. Lowry, Peri H. Fenwick, Kaitlin Roke, Khursheed N. Jeejeebhoy, Rupinder Dhaliwal, Paula Brauer, Dawna Royall, Angelo Tremblay, Doug Klein, David M. Mutch

Notice bibliographique

RevueLifestyle Genomics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of AlbertaSt. Michael's HospitalUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesHospital for Sick Children
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismAdiponectinMedicineMinor allele frequencyMetabolic syndromeDyslipidemiaInternal medicineCohortObesityGeneticsBiologyInsulin resistanceGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Metabolic syndrome (MetS) comprises a cluster of risk factors including central obesity, hypertension, dyslipidemia, and impaired glucose homeostasis. Lifestyle interventions that promote improvements in diet quality and physical activity represent a first line of therapy for MetS. However, varying responses to lifestyle interventions are well documented and may be partially explained by underlying genetic differences. The aim of this study was to investigate if variants in genes previously associated with MetS influence the magnitude of change in MetS risk during a 1-year lifestyle intervention. METHODS: The present study used data collected from the Canadian Health Advanced by Nutrition and Graded Exercise study cohort (n = 159 men and women) to investigate the effect of 17 candidate single nucleotide polymorphisms (SNPs) on response to a 1-year lifestyle intervention. Associations between SNPs and the continuous MetS (cMetS) score, as well as individual MetS components, were examined. RESULTS: Reductions in cMetS score at both 3 months and 1 year were significantly associated with 2 variants: rs662799 (A/G) in apolipoprotein A5 (APOA5) and rs1501299 (G/T) in adiponectin (ADIPOQ). Individuals carrying a minor T allele in rs1501299 experienced a greater reduction in cMetS score at both 3 months and 1 year, whereas major allele AA homozygotes in rs662799 experienced greater reductions in cMetS score during the intervention. No associations were identified between the aforementioned SNPs and individual components of MetS. Both un-weighted and weighted genetic risk scores (GRS) using these 2 SNPs revealed that individuals carrying none of the risk alleles experienced significantly greater reductions in cMetS score after 1 year. CONCLUSIONS: The findings from the current study suggest that individuals with certain genotypes may benefit more from a lifestyle intervention for MetS and that specific variants, either independently or as part of a GRS, could be used as a nutrigenomic tool to tailor the intervention to reduce the risk of MetS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil0,161

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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