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Enregistrement W2901193757 · doi:10.1530/rep-18-0366

Inhibition of RNA synthesis during Scriptaid exposure enhances gene reprogramming in SCNT embryos

2018· article· en· W2901193757 sur OpenAlexafffund
Vitor Braga Rissi, Werner Giehl Glanzner, Mariana Priotto de Macedo, Lady Katerine Serrano Mujica, Karine Campagnolo, Karina Gutierrez, Alessandra Bridi, Hernán Baldassarre, Paulo Bayard Dias Gonçalves, Vilceu Bordignon

Notice bibliographique

RevueReproduction · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensMcGill UniversitySte. Anne's Hospital
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésReprogrammingSomatic cell nuclear transferEmbryoCell biologyRNAGeneGene expressionBiologyChemistryAndrologyGeneticsEmbryogenesisBlastocystMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Insufficient epigenetic reprogramming is incompatible with normal development of embryos produced by somatic cell nuclear transfer (SCNT), but treatment with histone deacetylases inhibitors (HDACi) enhances development of SCNT embryos. However, the mechanisms underpinning HDACi benefits in SCNT embryos remain largely uncharacterized. We hypothesized that, in addition to enhancing reprogramming, HDACi treatment may promote expression of genes not required for early development of SCNT embryos. To test this hypothesis, RNA synthesis was inhibited by treating bovine SCNT embryos with 5,6-dichlorobenzimidazole 1-β-D-ribofuranoside (DBR), which were concomitantly treated or not with Scriptaid (Scrip; an HDACi). Development to the blastocyst stage was significantly increased by treatment with Scrip alone (26.6%) or associated with DRB (28.6%) compared to Control (17.9%). The total number of nuclei was significantly improved only in embryos that were treated with both Scrip + DRB. Nuclear decondensation after SCNT was significantly increased by DRB treatment either alone or associated with Scrip. The relative mRNA expression, evaluated during the embryo genome activation (EGA) transition, revealed that some KDMs (KDM1A, KDM3A, KDM4C and KDM6A) and DNMT1 where prematurely expressed in Scrip-treated embryos. However, treatment with Scrip + DRB inhibited early mRNA expression of those genes, as well as several other KDMs (KDM4A, KDM4B, KDM5A, KDM5B, KDM5C and KDM7A) compared to embryos treated with Scrip alone. These findings revealed that HDACi improved development in SCNT embryos compared to Control, but altered the expression of genes involved in epigenetic regulation and did not improve embryo quality. Inhibition of RNA synthesis during HDACi treatment enhanced nuclear chromatin decondensation, modulated gene expression and improved SCNT embryo quality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,432

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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