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Enregistrement W2901440309 · doi:10.1371/journal.pgen.1007788

Single-cell RNA-sequencing reveals transcriptional dynamics of estrogen-induced dysplasia in the ovarian surface epithelium

2018· article· en· W2901440309 sur OpenAlex
Nhung Vuong, David P. Cook, Laura A. Forrest, Lauren E. Carter, Pascale Robineau-Charette, Joshua M. Kofsky, Kendra Hodgkinson, Barbara C. Vanderhyden

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesOttawa Hospital Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Ottawa
Mots-clésBiologyOvarian cancerCellCancer researchPopulationEpitheliumEstrogenCell growthCell biologyCancerEndocrinologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Estrogen therapy increases the risk of ovarian cancer and exogenous estradiol accelerates the onset of ovarian cancer in mouse models. Both in vivo and in vitro, ovarian surface epithelial (OSE) cells exposed to estradiol develop a subpopulation that loses cell polarity, contact inhibition, and forms multi-layered foci of dysplastic cells with increased susceptibility to transformation. Here, we use single-cell RNA-sequencing to characterize this dysplastic subpopulation and identify the transcriptional dynamics involved in its emergence. Estradiol-treated cells were characterized by up-regulation of genes associated with proliferation, metabolism, and survival pathways. Pseudotemporal ordering revealed that OSE cells occupy a largely linear phenotypic spectrum that, in estradiol-treated cells, diverges towards cell state consistent with the dysplastic population. This divergence is characterized by the activation of various cancer-associated pathways including an increase in Greb1 which was validated in fallopian tube epithelium and human ovarian cancers. Taken together, this work reveals possible mechanisms by which estradiol increases epithelial cell susceptibility to tumour initiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,887

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle