Gene ontology analysis of expanded porcine blastocysts from gilts fed organic or inorganic selenium combined with pyridoxine
Notice bibliographique
Résumé
Gene ontology analysis using the microarray database generated in a previous study by this laboratory was used to further evaluate how maternal dietary supplementation with pyridoxine combined with different sources of selenium (Se) affected global gene expression of expanded porcine blastocysts. Data were generated from 18 gilts randomly assigned to one of three experimental diets ( n = 6 per treatment): i) basal diet without supplemental Se or pyridoxine (CONT); ii) CONT + 0.3 mg/kg of Na-selenite and 10 mg/kg of HCl-pyridoxine (MSeB 6 10); and iii) CONT + 0.3 mg/kg of Se-enriched yeast and 10 mg/kg of HCl-pyridoxine (OSeB 6 10). All gilts were inseminated at their fifth post-pubertal estrus and euthanized 5 days later for embryo harvesting. Differential gene expression between MSeB 6 10 vs CONT, OSeB 6 10 vs CONT and OSeB 6 10 vs MSeB 6 10 was performed using a porcine embryo-specific microarray. There were 559, 2458, and 1547 differentially expressed genes for MSeB 6 10 vs CONT, OSeB 6 10 vs CONT and OSeB 6 10 vs MSeB 6 10, respectively. MSeB 6 10 vs CONT stimulated 13 biological processes with a strict effect on RNA binding and translation initiation. OSeB 6 10 vs CONT and OSeB 6 10 vs MSeB 6 10 impacted 188 and 66 biological processes, respectively, with very similar effects on genome stability, ceramide biosynthesis, protein trafficking and epigenetic events. The stimulation of genes related with these processes was confirmed by quantitative real-time RT-PCR. Gene expression of embryos from OSeB 6 10 supplemented gilts was more impacted than those from MSeB 6 10 supplemented gilts. Whereas maternal OSeB 6 10 supplementation influenced crucial aspects of embryo development, maternal MSeB 6 10 supplementation was restricted to binding activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».