A High-throughput Bead-based Affinity Assay Enables Analysis of Genital Protein Signatures in Women At Risk of HIV Infection
Notice bibliographique
Résumé
= 25) were sampled at one time point. All study subjects were examined for demographic parameters associated with susceptibility to HIV infection. The cervicovaginal samples were analyzed using a high-throughput bead-based affinity assay. Proteins involved in epithelial barrier function and inflammation were increased in HIV-serodiscordant women. By combining several methods of analysis, a total of five proteins (CAPG, KLK10, SPRR3, elafin/PI3, CSTB) were consistently associated with this study group. Proteins analyzed using the affinity set-up were further validated by label-free tandem mass spectrometry in a partially overlapping cohort with concordant results. Women living in HIV-serodiscordant relationships thus had elevated levels of proteins involved in epithelial barrier function and inflammation despite low prevalence of sexually transmitted infections and a high frequency of safe sex practices. The identified proteins are important markers to follow during assessment of mucosal HIV susceptibility factors and a high-throughput bead-based affinity set-up could be a suitable method for such evaluation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».