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Enregistrement W2902340796 · doi:10.1039/c8ra08515c

Protein-induced fluorescence enhancement for a simple and universal detection of protein/small molecule interactions

2018· article· en· W2902340796 sur OpenAlexaff
Hansol Kim, Chang Yeol Lee, Jayeon Song, Junhyeok Yoon, Ki Soo Park, Hyun Gyu Park

Notice bibliographique

RevueRSC Advances · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiotin and Related Studies
Établissements canadiensKootenay Association for Science & Technology
Organismes subventionnairesMinistry of Science, ICT and Future PlanningNational Research Foundation
Mots-clésFluorescenceBiotinStreptavidinChemistryBiophysicsSmall moleculeFolate receptorTarget proteinBiotinylationProtein–protein interactionBiological systemBiochemistryBiologyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We herein describe a novel and efficient method for the detection of protein/small molecule (SM) interactions, which relies on the protein-induced fluorescence enhancement (PIFE). In this method, a duplex probe is designed to position Cy3 and SM at the optimal distance to maximize the effect of PIFE, which is utilized as the key component. In the presence of target proteins that bind to SM, the Cy3 is guided close to the target proteins, which significantly enhances the fluorescence signal through a process of PIFE. With this approach, we successfully analyzed a model target protein, streptavidin (STV) that interacts with biotin (BTN) in less than 10 min without any washing steps. In addition, the practical applicability of this method was demonstrated by reliably determining STV in human serum. Finally, the universal applicability of this method was demonstrated by monitoring the interaction between folate and folate receptors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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