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Enregistrement W2902528700 · doi:10.1093/ofid/ofy210.372

361. Changing Epidemiology of <i>Blastomyces dermatitidis</i> Infection in Quebec, Canada: A Retrospective Multicenter Study

2018· article· en· W2902528700 sur OpenAlexaffabout
Kevin W. Dufour, Andrée Ann Pelletier, Mélina Denis, Nicolas Gagnon, Philippe J. Dufresne, Claire Nour Abou Chakra, Alex Carignan

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensInstitut National de Santé Publique du QuébecCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBlastomycosisInterquartile rangeRetrospective cohort studyEpidemiologyInternal medicineBlastomyces dermatitidisTransplantationImmunosuppressionIncidence (geometry)Mortality ratePediatricsImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the wake of the increased incidence of blastomycosis in Quebec province, Canada, clinicians have observed a possible increase of severity in patients, with occasional death. This study aimed to assess temporal changes in blastomycosis severity and mortality in Quebec, and to identify risk factors for mortality of blastomycosis. A retrospective multicenter cohort study of patients with confirmed blastomycosis identified in a database at the provincial laboratory (Laboratoire de santé public du Québec) between 1988 and 2016. Severe cases were defined as patients with septic shock and/or acute respiratory distress syndrome and/or requiring mechanical ventilation. Immunosuppression included corticosteroid use, HIV, immunosuppressive therapy for inflammatory disease, chemotherapy, and transplantation. The primary outcome was 90-day all-cause mortality. Risk factors for mortality were identified by multivariate logistic regression. Over the study period, 220 blastomycosis cases were identified. Medical charts for 176 patients from 17 institutions were available and complete for data collection. The median age of patients was 55.3 years (interquartile range 45–67). Infection led to hospitalization of 119 patients (68%). Pulmonary involvement was recorded for 81% of cases (142/176) and two organs or more were involved in 35% (61/176). An increase in severity was observed mainly in recent years [1988–1997: 1/32 (3%); 1998–2007: 9/54 (17%); 2008–2016: 19/89 (21%); P = 0.05]. The overall mortality was 17.6% (31/176); 6% (2/33) in 1988–1997, 20% (n = 11/54) in 1998–2007 and 20% in 2008- 2016 (n = 18/89) (P = 0.15). There was also a significant increase in age at diagnosis (P = 0.005), the proportion of diabetic patients (P = 0.03) and the proportion of immunocompromised patients (P = 0.009) over time. The independent risk factors of mortality were age (aOR 1.03 for each additional year, 95% CI 1.0–1.06, P = 0.05) and immunosuppression (aOR 3.62, 95% CI 1.54–8.49, P = 0.003). The severity of blastomycosis observed in Quebec over the past 30 years has increased. These changes could be explained in part by an increase in the number of immunosuppressed patients. However, mortality has remained stable in recent years. All authors: No reported disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,112

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
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