The complete male-type mitochondrial genomes of the Fatmucket, <i>Lampsilis siliquoidea</i>, and the endangered Arkansas Fatmucket, <i>Lampsilis powellii</i>
Notice bibliographique
Résumé
Doubly uniparental inheritance (DUI) is a unique mode of mitochondrial (mt) inheritance found only in some bivalve molluscs. Under DUI, both maternal (i.e. female-transmitted or F-type) and paternal (i.e. male-transmitted or M-type) mitochondrial genomes are transmitted. In addition to typical mt genes, these F- and M-type genomes each contain a distinct novel open reading frame, termed the f- and m-orf, respectively. Herein, the M-type mitochondrial genomes of Lampsilis siliquoidea and Lampsilis powellii (two putative unionid species within Unionidae) are presented. Relatively few M-type mitochondrial genomes have been sequenced. Consequently, these results are valuable for the on-going study of patterns of molecular evolution of DUI genomes. Both a phylogenetic analysis and an in silico analysis of the novel ORFs were conducted. Consistent with previous studies of unionoid M-type genomes, our results demonstrate the presence of a putative transmembrane domain in these M-ORFs with properties similar to those of M-ORFs of closely related species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,007 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».