A novel <i>qacA</i> allele results in an elevated chlorhexidine glu conate minimum inhibitory concentration in cutaneous <i>Staphylococcus epidermidis</i> isolates
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Chlorhexidine gluconate (CHG) is a topical antiseptic widely used in healthcare settings. In Staphylococcus spp., the pump QacA effluxes CHG, while the closely related QacB cannot due to a single amino acid substitution. We characterized 1,050 cutaneous Staphylococcus isolates obtained from 173 pediatric oncology patients enrolled in a multicenter CHG bathing trial. CHG susceptibility testing revealed 63 (6%) of these isolates had elevated CHG MICs (≥ 4 μg/mL). Screening of all 1,050 isolates for qacA/B by restriction fragment length polymorphism (RFLP) yielded 56 isolates with a novel qacA/B RFLP pattern, qacAB 273 . The CHG MIC was significantly higher for qacAB 273 -positive isolates (MIC 50 : 4 μg/mL, [range: 0.5 – 4 μg/mL]) compared to other qac groups: qacA -positive (n=559, 1 μg/mL, [0.5 – 4 μg/mL]), qacB -positive (n=17, 1 μg/mL, [0.25 – 2 μg/mL]), and qacA/B- negative (n=418, 1 μg/mL, [0.125 – 2 μg/mL], p=0.001). The qacAB 273 -positive isolates also displayed a high proportion of methicillin resistance (96.4%) compared to other qac groups (24.9 – 61.7%, p=0.001). Whole genome sequencing revealed that qacAB 273 -positive isolates encoded a variant of QacA with 2 amino acid substitutions. This new allele, named qacA4 , was carried on the novel plasmid pAQZ1. The qacA4 -carrying isolates belonged to the highly resistant S. epidermidis clone ST2 and were collected from multiple centers across the United States and Canada. Curing an isolate of qacA4 resulted in a four-fold decrease in the CHG MIC, confirming the role of qacA4 in the elevated CHG MIC. Our results highlight the importance of further studying qacA4 and its functional role in clinical staphylococci. Importance Staphylococcus epidermidis is an important cause of infections in patients with implanted devices. Bathing with chlorhexidine gluconate (CHG), a topical antiseptic, has been shown to reduce rates of device-associated infections, especially those caused by S. epidermidis . In S. epidermidis , reduced susceptibility to CHG is associated with carriage of the qacA gene. As part of a multicenter CHG bathing trial, we obtained cutaneous Staphylococcus isolates from pediatric oncology patients across the United States and Canada. We identified a group of isolates capable of surviving in higher concentrations of CHG and determined a novel allele of qacA , termed qacA4 and carried on the novel plasmid pAQZ1, was responsible for the isolates’ survival in higher CHG concentrations. The qacA4 -carrying S. epidermidis isolates belonged to the highly resistant and virulent ST2 clonal type. Our results highlight the need to understand the global distribution of novel qacA alleles, including qacA4 , and their mechanistic effect on efflux.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».