Abstract P223: Identification of Chromosome 2 Differentially Expressed Genes Linked to Vascular Inflammation Using Congenic Rats Fed a Normal and High-Salt Diet
Notice bibliographique
Résumé
Background: The immune system plays an important role in hypertension. Chromosome 2 (Chr2) introgression from normotensive Brown Norway (BN) rats into hypertensive Dahl salt sensitive (SS) background (consomic SB2) reduced blood pressure (BP), and vascular inflammation under a normal-salt diet (NSD). We hypothesized that BN Chr2 contains anti-inflammatory genes that could prevent BP elevation and vascular inflammation in rats fed NSD and high-salt diet (HSD). These genes will be identified using microRNA (miRNA) and total RNA sequencing in aorta of congenic rats containing different portions of BN Chr2 under NSD and HSD. Methods and Results: Four-to-6 week-old male SS and congenic SB2a and SB2b rats were fed a NSD or HSD (4% NaCl) for 8 weeks. Telemetry systolic BP (SBP) was lower in SB2a and SB2b compared to SS (125±3, 127±6 vs 146±2 mm Hg, P <0.05) under NSD and tended to be higher in SB2b but not in SB2a when compared to SS (185±8, 167±7 vs 168±5 mm Hg) under HSD. RNA was extracted from aorta and used for small and total RNA sequencing using Illumina HiSeq-2500. Differentially expressed (DE) miRNAs and genes (mRNAs and non-coding RNAs [ncRNAs]) encoded in BN Chr2 introgressed portions were identified with fold change ≤ or ≥1.5 and FDR<0.05 in SB2a vs SS (miRNAs: 2 up (↑) and 2 down (↓), mRNAs: 8 ↑ and 10 ↓, ncRNA: 1 ↓) under NSD and (miRNAs: 12 ↑ and 14 ↓; mRNAs: 188↑ and 259 ↓, ncRNAs: 1 ↑ and 11 ↓) under HSD; and SB2b vs SS (miRNAs: 2 ↑ and 4 ↓, mRNAs: 26 ↑ and 85 ↓; ncRNAs: 1 ↑ and 2 ↓) under NSD and (mRNAs: 6 ↑ and 11 ↓, ncRNAs: 1 ↑ and 3 ↓) under HSD. Ddah1 was down-regulated in SB2a vs SS rats fed NSD and HSD, while Acad9 , Agtr1b, ncRNA AABR07012047.1 , Fbxw7, Ptgfrn were down-regulated and ncRNA AABR07012585.3 , Bbs12, Kcnab1 were up-regulated in SB2b vs SS rats fed NSD and HSD. DE RNAs were confirmed by reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). Correlation between RNA-sequencing and RT-qPCR data was demonstrated for 6 of 9 tested RNAs: Kcnab1 (r=0.86, P <3.3E-9), Agtr1b (r=0.85, P <6E-9), Ddah1 (r=0.78 , P <5.0E-7) , Bbs12 (r=0.72, P <6.4E-6), Ptgfrn (r=0.54, P <0.005), and AABR07012047.1 (r=0.48, P <0.05). Conclusions: BN Chr2 encoded DE genes were identified in aorta of congenic SB2a and SB2b rats fed NSD and HSD. Whether these genes play a role in vascular inflammation remains to be determined.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».