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Enregistrement W2905106087 · doi:10.1002/cpsc.75

Combinatorial Utilization of Murine Embryonic Stem Cells and <i>In Vivo</i> Models to Study Human Congenital Heart Disease

2018· article· en· W2905106087 sur OpenAlexafffund
Abeer Zakariyah, Rashida Rajgara, Michael Shelton, Alexandre Blais, Ilona S. Skerjanc, Patrick G. Burgon

Notice bibliographique

RevueCurrent Protocols in Stem Cell Biology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésEmbryonic stem cellBiologyStem cellIn vivoCell biologyEmbryonic heartDiseaseImmunologyGeneticsPathologyGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We have established an in vitro model of the human congenital heart defect (CHD)–associated mutation NKX2.5 R141C . We describe the use of the hanging drop method to differentiate Nkx2.5 R141C/+ murine embryonic stem cells (mESCs) along with Nkx2.5 +/+ control cells. This method allows us to recapitulate the early stages of embryonic heart development in tissue culture. We also use qRT‐PCR and immunofluorescence to examine samples at different time points during differentiation to validate our data. The in vivo model is a mouse line with a knock‐in of the same mutation. We describe the isolation of RNA from embryonic day 8.5 (E8.5) embryos and E9.5 hearts of wild‐type and mutant mice. We found that the in vitro model shows reduced cardiomyogenesis, similar to Nkx2.5 R141C/+ embryos at E8.5, indicating a transient loss of cardiomyogenesis at this time point. These results suggest that our in vitro model can be used to study very early changes in heart development that cause CHD. © 2018 by John Wiley &amp; Sons, Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,868

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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