Engineering Arabidopsis long-chain acyl-CoA synthetase 9 variants with enhanced enzyme activity
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Long-chain acyl-CoA synthetase (LACS, EC 6.2.1.3) catalyzes the ATP-dependent activation of free fatty acid to form acyl-CoA, which, in turn, serves as the major acyl donor for various lipid metabolic pathways. Increasing the size of acyl-CoA pool by enhancing LACS activity appears to be a useful approach to improve the production and modify the composition of fatty acid-derived compounds, such as triacylglycerol. In the present study, we aimed to improve the enzyme activity of Arabidopsis thaliana LACS9 (AtLACS9) by introducing random mutations into its cDNA using error-prone PCR. Two AtLACS9 variants containing multiple amino acid residue substitutions were identified with enhanced enzyme activity. To explore the effect of each amino acid residue substitution, single-site mutants were generated and the amino acid substitutions C207F and D238E were found to be primarily responsible for the increased activity of the two variants. Furthermore, evolutionary analysis revealed that the beneficial amino acid site C207 is conserved among LACS9 from plant eudicots, whereas the other beneficial amino acid site D238 might be under positive selection. Together, our results provide valuable information for the production of LACS variants for applications in the metabolic engineering of lipid biosynthesis in oleaginous organisms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».