Abstract P151: Short- and Long-Term Induction of Human Endothelin-1 Overexpression in Mice Up-Regulated the Expression of <i>Khdrbs3</i> in Mesenteric Arteries
Notice bibliographique
Résumé
Background: Transgenic mouse with tamoxifen-inducible endothelium-restricted human ET-1 overexpression (ieET-1) exhibited blood pressure (BP) elevation three weeks (short-term) and three months after induction (long-term). Vascular injury was observed only after long-term exposure to endothelial ET-1 overexpression. It is unknown whether short or long-term exposure to ET-1 overexpression results in gene dysregulation. We aimed to identify differentially expressed (DE) microRNAs (miRs) and genes in mesenteric arteries of ieET-1 mice after short- and long-term induction of human ET-1 overexpression. Methods and Results: Ten to 12-week old male ieET-1 mice and control ieCre mice expressing a tamoxifen-inducible Cre recombinase under the control of endothelium-specific Tie2 promoter, were treated with tamoxifen (1 mg/kg/day, s.c.) for 5 days and sacrificed 16 days or 3 month later. RNA was extracted from mesenteric arteries of ieCre and ieET-1 mice and used for small and total RNA-sequencing using Illumina HiSeq-2500. EdgeR was used for differential expression analysis (false discovery rate <0.05, fold change ≤ or ≥ 1.5). No DE miRs were identified. DE genes were identified in ieET-1 compared to ieCre mice after short-term induction (mRNAs: 1 up and 6 down; non-coding [nc]RNAs: 3 up) and after long-term induction (mRNA: 1 up). Khdrbs3 (KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3), which was up-regulated after both short- and long-term exposure to endothelial ET-1 overexpression, was validated by reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). We demonstrated a correlation between RNA-sequencing and RT-qPCR data for short- and long-term groups (r=0.8, P <0.0005). The mRNA expression of Khdrbs3 was 2 times more in fibroblasts than in smooth muscle cells and endothelial cells (2.37±0.28 vs. 1.11±0.17 and 1.12±0.12, P <0.01). Conclusions: The results showed that short- and long-term exposure to endothelial ET-1 overexpression up-regulated Khdrbs3 in mesenteric arteries. In vitro study revealed that this gene was expressed to a greater level in fibroblasts than other vascular cells. However, the role of Khdrbs3 in ET-1-induced vascular injury remains to be determined.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».