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Enregistrement W2905446542 · doi:10.1093/jas/sky404.044

231 Urinary metabotyping around parturition indicates consistent metabolite signatures that can be used for monitoring and diagnosing of subclinical mastitis in dairy cows.

2018· article· en· W2905446542 sur OpenAlexaff
Burim N. Ametaj, Guanshi Zhang, Elda Dervishi, David S. Wishart

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueReproductive Physiology in Livestock
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubclinical infectionUrineMedicineMetaboliteIce calvingUrinary systemMastitisAnimal scienceInternal medicineLactationPregnancyPhysiologyBiologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to identify urinary metabolite signatures that can be used for monitoring and diagnosing of subclinical mastitis in Holstein dairy cows. Six multiparous pregnant Holstein cows with subclinical mastitis (SCM) and 20 healthy controls (CON) were selected out of 100 cows in the study. DI/LC-MS/MS-based urinary analyses were conducted on samples collected at -8, -4, SCM diagnosis, and at +4 and +8 wks around the expected day of calving. Data indicated that 14 amino acids and derivatives were found in the urine with Gln and SDMA consistently increased (P<0.005) in the urine of SCM cows. Out of 39 acylcarnitines (ACs) quantified C12:DC, C14, and C18:2, were higher (P<0.05) in SCM at all time points (P<0.05). Seventeen ACs at -8 wks, 10 at -4 wks, 23 at disease wk, 8 at +4 wks, and 12 at +8 wks were higher (P<0.05) in the urine of SCM cows. Most of the alterations regarding lysophosphatidylcholines (LPCs) were found at -8 and -4 wks prepartum with 6 and 4 LPCs species lowered at -8 and -4 wks, respectively (P<0.05). Multiple sphingomyelin (SM) species prior to calving (3 at -8 wks and 8 at -4 wks) and 2 at disease week were lowered in SCM cows (P<0.05). A total of 74 phosphatidylcholines (PCs) were measured in the urine. A total of 12, 12, 10, 9, and 9 species of PC aa and 7, 15, 15, 3, and 3 species of PC ae were altered during weeks -8, -4, Disease wk, +4, + 8 wks around calving. Overall, multiple metabolite species related to amino acids, ACs, LPCs, and PCs metabolism were identified as altered in the urine of periparturient dairy cows. Some of the most important metabolites might be used as biomarkers to screen cows for SCM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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