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Enregistrement W2905814499

UCHL1 expression is a poor prognostic marker in non-small cell lung cancer

2006· article· en· W2905814499 sur OpenAlexaff
Chang‐Qi Zhu, Suzanne K. Lau, Davina Lau, Geoffrey Liu, Ming‐Sound Tsao

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCohortStage (stratigraphy)Lung cancerCancerInternal medicineImmunohistochemistryOncologyPathologyMedicineCarcinomaBiologyCancer researchGastroenterology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1194 Background: UCHL1 is a susceptible gene for Parkinson’s disease and has both deubiquitinase and ubiquitin ligase activities. It is commonly overexpressed in a variety of carcinomas including lung cancers. UCHL1 expression in esophageal squamous cell carcinoma and pancreatic carcinoma may also be downregulated by promoter hypermethylation. UCHL-1 is also involved in neural cell apoptosis. Materials & Methods: Quantitative-PCR (qPCR) was used to assay the expression levels of UCHL1 in two independent cohorts of non-small cell lung carcinoma (NSCLC). Cohort 1 consisted of 116 stage I-III tumors and 38 non-neoplastic tissues. The mean±95% CI of the normal was used to define the range of normal expression. Cohort 2 consisted of 172 resected NSCLC samples with similar clinical features as cohort 1. UCHL1 expression was also assessed in 10 NSCLC xenografts. Results: In cohort 1, 29.3% (34/116) overexpressed, while 3.4% (4/116) underexpressed UCHL1. Overexpression was more common in Stage I patients (32.9%) and in squamous cell carcinoma (SQCC) (51.5%). UCHL1 expression levels were also higher in smokers (p=0.012). In stage I, UCHL1 overexpression was positively correlated with differentiation grade (p=0.014) and significantly associated with shorter survival time [HR=2.57 (95%CI 1.18-5.61), p=0.017]. The survival difference remained significant even in multivariate analysis for all cases [HR=1.05 (1.02-1.08), p=0.002]. However, it was noteworthy that the 4 cases (including 2 in Stage I) that had low UCHL1 expression succumbed to NSCLC within 3 years. Cohort 2 validated findings of cohort I. Survival analysis showed a significant association between UCHL1 expression and shorter overall survival after adjustment for stage and differentiation [HR=1.25 (1.05-1.53), p=0.03]. In NSCLC xenografts, tumor growth was positively correlated with high UCHL1 expression. Interestingly, although tumors with the lowest levels of UCHL1 expression (RVH6849 and A549) grew slower than those with high expression, they also grew faster than those with intermediate expression. Moreover, the expression of UCHL1 was correlated with higher tumorigenicity in an in vitro study. Conclusion: Overexpression of UCHL1 was more frequent in early stage NSCLC and in SQCC, and was associated with shorter overall survival. However, downregulation of UCHL1 also appeared to be associated with poor prognosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
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