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Enregistrement W2905948744 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-18-1726

SMAD4 Loss in Colorectal Cancer Patients Correlates with Recurrence, Loss of Immune Infiltrate, and Chemoresistance

2018· article· en· W2905948744 sur OpenAlexaff
Isaac Wasserman, Lik Hang Lee, Shuji Ogino, Michael R. Marco, Chao Wu, Xi Chen, Jashodeep Datta, Eran Sadot, Bryan Szeglin, José G. Guillem, Philip B. Paty, Martin R. Weiser, Garrett M. Nash, Leonard B. Saltz, Afşar Barlas, Katia Manova‐Todorova, Srijaya Prakash Babu Uppada, Arthur E. Elghouayel, Peter Ntiamoah, Jonathan N. Glickman, Tsuyoshi Hamada, Keisuke Kosumi, Kentaro Inamura, Andrew T. Chan, Reiko Nishihara, Andrea Cercek, Karuna Ganesh, Nancy E. Kemeny, Punita Dhawan, Rona Yaeger, Charles L. Sawyers, Julio García‐Aguilar, Marios Giannakis, Jinru Shia, J. Joshua Smith

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesOffice of Extramural Research, National Institutes of HealthNational Cancer InstituteSociety of Memorial Sloan KetteringNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesStand Up To CancerAssociation for Academic SurgeryMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterAmerican Society of Colon and Rectal SurgeonsAmerican College of SurgeonsU.S. Department of Veterans AffairsDana-Farber/Harvard Cancer CenterHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésCohortMedicineInterquartile rangeColorectal cancerInternal medicineOncologyCancerImmune systemChemotherapyGastroenterologyAdjuvant therapyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose: SMAD4 has shown promise in identifying patients with colorectal cancer at high risk of recurrence or death. Experimental Design: A discovery cohort and independent validation cohort were classified by SMAD4 status. SMAD4 status and immune infiltrate measurements were tested for association with recurrence-free survival (RFS). Patient-derived xenografts from SMAD4-deficient and SMAD4-retained tumors were used to examine chemoresistance. Results: The discovery cohort consisted of 364 patients with stage I–IV colorectal cancer. Median age at diagnosis was 53 years. The cohort consisted of 61% left-sided tumors and 62% stage II/III patients. Median follow-up was 5.4 years (interquartile range, 2.3–8.2). SMAD4 loss, noted in 13% of tumors, was associated with higher tumor and nodal stage, adjuvant therapy use, fewer tumor-infiltrating lymphocytes (TIL), and lower peritumoral lymphocyte aggregate (PLA) scores (all P < 0.04). SMAD4 loss was associated with worse RFS (P = 0.02). When stratified by SMAD4 and immune infiltrate status, patients with SMAD4 loss and low TIL or PLA had worse RFS (P = 0.002 and P = 0.006, respectively). Among patients receiving 5-fluorouracil (5-FU)-based systemic chemotherapy, those with SMAD4 loss had a median RFS of 3.8 years compared with 13 years for patients with SMAD4 retained. In xenografted mice, the SMAD4-lost tumors displayed resistance to 5-FU. An independent cohort replicated our findings, in particular, the association of SMAD4 loss with decreased immune infiltrate, as well as worse disease-specific survival. Conclusions: Our data show SMAD4 loss correlates with worse clinical outcome, resistance to chemotherapy, and decreased immune infiltrate, supporting its use as a prognostic marker in patients with colorectal cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,444
Écart entre enseignants0,372 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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