SMAD4 Loss in Colorectal Cancer Patients Correlates with Recurrence, Loss of Immune Infiltrate, and Chemoresistance
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Purpose: SMAD4 has shown promise in identifying patients with colorectal cancer at high risk of recurrence or death. Experimental Design: A discovery cohort and independent validation cohort were classified by SMAD4 status. SMAD4 status and immune infiltrate measurements were tested for association with recurrence-free survival (RFS). Patient-derived xenografts from SMAD4-deficient and SMAD4-retained tumors were used to examine chemoresistance. Results: The discovery cohort consisted of 364 patients with stage I–IV colorectal cancer. Median age at diagnosis was 53 years. The cohort consisted of 61% left-sided tumors and 62% stage II/III patients. Median follow-up was 5.4 years (interquartile range, 2.3–8.2). SMAD4 loss, noted in 13% of tumors, was associated with higher tumor and nodal stage, adjuvant therapy use, fewer tumor-infiltrating lymphocytes (TIL), and lower peritumoral lymphocyte aggregate (PLA) scores (all P < 0.04). SMAD4 loss was associated with worse RFS (P = 0.02). When stratified by SMAD4 and immune infiltrate status, patients with SMAD4 loss and low TIL or PLA had worse RFS (P = 0.002 and P = 0.006, respectively). Among patients receiving 5-fluorouracil (5-FU)-based systemic chemotherapy, those with SMAD4 loss had a median RFS of 3.8 years compared with 13 years for patients with SMAD4 retained. In xenografted mice, the SMAD4-lost tumors displayed resistance to 5-FU. An independent cohort replicated our findings, in particular, the association of SMAD4 loss with decreased immune infiltrate, as well as worse disease-specific survival. Conclusions: Our data show SMAD4 loss correlates with worse clinical outcome, resistance to chemotherapy, and decreased immune infiltrate, supporting its use as a prognostic marker in patients with colorectal cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».