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Enregistrement W2906643351 · doi:10.1128/aac.01651-18

Method-Dependent Epidemiological Cutoff Values for Detection of Triazole Resistance in <i>Candida</i> and <i>Aspergillus</i> Species for the Sensititre YeastOne Colorimetric Broth and Etest Agar Diffusion Methods

2018· article· en· W2906643351 sur OpenAlexaff
Ana Espinel‐Ingroff, John Turnidge, Ana Alastruey‐Izquierdo, Françoise Botterel, Rafael Cantón, C. Castro, Yee‐Chun Chen, Yan Chen, Erja Chryssanthou, Éric Dannaoui, Guillermo García‐Effrón, Gloria M. González, Nelesh P. Govender, Jesús Guinea, Sarah Kidd, Michaela Lackner, Cornelia Lass‐Flörl, María José Linares-Sicilia, Leire López-Soria, Rindidzani E. Magobo, Teresa Peláez, Guillermo Quindós, M. A. Rodriguez-Iglesia, Maite Ruiz, F Sánchez, Maurizio Sanguinetti, Ryan K. Shields, Piotr Szweda, Anna Maria Tortorano, Nancy L. Wengenack, Simone Bramati, C. Cavanna, C. DeLuca, Maria Luisa Gelmi, Anna Grancini, Giuseppe Lombardi, Joseph Meletiadis, C. E. Negri, Marco Passera, Javier Pemán, Anna Prigitano, E. Sala, M. Tejada

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensPublic Health Ontario
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversidad Nacional del Litoral
Mots-clésEtestMicrobiologyBiologyCandida parapsilosisPosaconazoleCandida glabrataCandida kruseiCandida albicansCorpus albicansItraconazoleAntifungal

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although the Sensititre Yeast-One (SYO) and Etest methods are widely utilized, interpretive criteria are not available for triazole susceptibility testing of Candida or Aspergillus species. We collected fluconazole, itraconazole, posaconazole, and voriconazole SYO and Etest MICs from 39 laboratories representing all continents for (method/agent-dependent) 11,171 Candida albicans , 215 C. dubliniensis , 4,418 C. glabrata species complex, 157 C. guilliermondii ( Meyerozyma guilliermondii ), 676 C. krusei ( Pichia kudriavzevii ), 298 C. lusitaniae ( Clavispora lusitaniae ), 911 C. parapsilosis sensu stricto , 3,691 C. parapsilosis species complex, 36 C. metapsilosis , 110 C. orthopsilosis , 1,854 C. tropicalis , 244 Saccharomyces cerevisiae , 1,409 Aspergillus fumigatus , 389 A. flavus , 130 A. nidulans , 233 A. niger , and 302 A. terreus complex isolates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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