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Enregistrement W2906650498 · doi:10.1016/j.cmet.2018.11.015

Cellular Metabolism Is a Major Determinant of HIV-1 Reservoir Seeding in CD4+ T Cells and Offers an Opportunity to Tackle Infection

2018· article· en· W2906650498 sur OpenAlexaff
José Carlos Valle‐Casuso, Mathieu Angin, Stevenn Volant, Caroline Passaes, Valérie Monceaux, Anastassia Mikhailova, Katia Bourdic, Véronique Avettand-Fènoël, Faroudy Boufassa, Marc Sitbon, Olivier Lambotte, Maria‐Isabel Thoulouze, Michaela Müller‐Trutwin, Nicolas Chomont, Asier Sáez‐Cirión

Notice bibliographique

RevueCell Metabolism · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesJanssen BiotechViiV HealthcareAgence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites ViralesSidactionGilead SciencesInstitut PasteuramfAR, The Foundation for AIDS Research
Mots-clésGlycolysisBiologyPhenotypeHuman immunodeficiency virus (HIV)Oxidative phosphorylationCellIn vitroCell biologyCytotoxic T cellImmunologyMetabolismGeneticsBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HIV persists in long-lived infected cells that are not affected by antiretroviral treatment. These HIV reservoirs are mainly located in CD4 + T cells, but their distribution is variable in the different subsets. Susceptibility to HIV-1 increases with CD4 + T cell differentiation. We evaluated whether the metabolic programming that supports the differentiation and function of CD4 + T cells affected their susceptibility to HIV-1. We found that differences in HIV-1 susceptibility between naive and more differentiated subsets were associated with the metabolic activity of the cells. Indeed, HIV-1 selectively infected CD4 + T cells with high oxidative phosphorylation and glycolysis, independent of their activation phenotype. Moreover, partial inhibition of glycolysis (1) impaired HIV-1 infection in vitro in all CD4 + T cell subsets, (2) decreased the viability of preinfected cells, and (3) precluded HIV-1 amplification in cells from HIV-infected individuals. Our results elucidate the link between cell metabolism and HIV-1 infection and identify a vulnerability in tackling HIV reservoirs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations192
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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