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Enregistrement W2907193858 · doi:10.5376/mpb.2019.10.0001

Expression Analysis of <i>CBL1</i> and <i>CBL6</i> Genes in Sugarcane under Abiotic Stress

2019· article· en· W2907193858 sur OpenAlexvenueno aff
Qiuping Ling, Qiaoying Zeng, Jiayun Wu, Fei Hu, Qiwei Li, Yongwen Qi

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAbiotic stressGeneAbiotic componentGene expressionGeneticsBotanyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CBLs (Calcineurin B-like proteins) is a type of special calcium sensors in plants, which plays an important role in response to stress. We derived SsCBL1 and SsCBL6 genes in sugarcane from NCBI databases. SsCBL1 gene contained a complete open reading frame of 642 bp, encoding a protein with 213 amino acids. SsCBL6 gene contained a complete open reading frame of 672 bp, encoding a protein with 223 amino acids. The structure of SsCBL1 and SsCBL6 encoding protein was analyzed by bioinformatics methods. The results showed that both of them had no transmembrane segment but contained four EF-hand domains. The phylogenetic tree analysis indicated that SsCBL1 and SsCBL6 were closely related to CBL1 and CBL6 in other plants, which were highly conservative. The results of real-time quantitative PCR demonstrated that the expression of two genes changed under low nitrogen, low phosphorus, low potassium, drought, salt and ABA stress, respectively. The expression was strongly induced by drought and salt treatments for SsCBL1 , while the expression of SsCBL6 was strongly induced by low potassium, drought and salt treatment. Real-time quantitative analysis suggested that SsCBL1 and SsCBL6 might play important regulatory roles under various stresses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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