Expression Analysis of <i>CBL1</i> and <i>CBL6</i> Genes in Sugarcane under Abiotic Stress
Notice bibliographique
Résumé
CBLs (Calcineurin B-like proteins) is a type of special calcium sensors in plants, which plays an important role in response to stress. We derived SsCBL1 and SsCBL6 genes in sugarcane from NCBI databases. SsCBL1 gene contained a complete open reading frame of 642 bp, encoding a protein with 213 amino acids. SsCBL6 gene contained a complete open reading frame of 672 bp, encoding a protein with 223 amino acids. The structure of SsCBL1 and SsCBL6 encoding protein was analyzed by bioinformatics methods. The results showed that both of them had no transmembrane segment but contained four EF-hand domains. The phylogenetic tree analysis indicated that SsCBL1 and SsCBL6 were closely related to CBL1 and CBL6 in other plants, which were highly conservative. The results of real-time quantitative PCR demonstrated that the expression of two genes changed under low nitrogen, low phosphorus, low potassium, drought, salt and ABA stress, respectively. The expression was strongly induced by drought and salt treatments for SsCBL1 , while the expression of SsCBL6 was strongly induced by low potassium, drought and salt treatment. Real-time quantitative analysis suggested that SsCBL1 and SsCBL6 might play important regulatory roles under various stresses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».