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Enregistrement W2907861025 · doi:10.1101/509109

Cysteine oxidation triggers amyloid fibril formation of the tumor suppressor p16 <sup>INK4A</sup>

2019· preprint· en· W2907861025 sur OpenAlexaff
Christoph Göbl, Vanessa K. Morris, Loes van Dam, Marieke Visscher, Paulien E. Polderman, Christoph Hartlmüller, Hesther de Ruiter, Manuel Hora, Laura Liesinger, Ruth Birner‐Gruenberger, Harmjan R. Vos, Bernd Reif, Tobias Madl, Tobias B. Dansen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilBioTechMed-GrazKWF KankerbestrijdingAustrian Science FundMedical Research CouncilÖsterreichische ForschungsförderungsgesellschaftHelmholtz Zentrum MünchenNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésCysteineFibrilChemistryAmyloid (mycology)RedoxBiophysicsOxidative stressSuppressorCell biologyBiochemistryBiologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Accumulation of the CDK4/6 inhibitor p16 INK4A in response to oncogenic transformation leads to cell cycle arrest and senescence and is therefore frequently lost in cancer. p16 INK4A is also known to accumulate under conditions of oxidative stress and thus could potentially be regulated by the reversible oxidation of cysteines (redox signaling). Indeed, oxidation of the single cysteine in p16 INK4A in human cells occurs under relatively mild oxidizing conditions and leads to disulfide-dependent dimerization. p16 INK4A is an all alpha-helical protein, but here we report that upon cysteine-dependent dimerization, p16 INK4A undergoes a dramatic structural rearrangement and forms aggregates that have the typical features of amyloid fibrils, including binding of diagnostic dyes, presence of cross-β sheet structure, and typical dimensions found in electron microscopy. p16 INK4A amyloid formation abolishes its function as a CDK4/6 inhibitor. Collectively, these observations mechanistically link the cellular redox state to the inactivation of p16 INK4A through the formation of amyloid fibrils.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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