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Enregistrement W2909310706 · doi:10.1172/jci123959

Loss of the sphingolipid desaturase DEGS1 causes hypomyelinating leukodystrophy

2019· article· en· W2909310706 sur OpenAlexafffund
Devesh C. Pant, Imen Dorboz, Agatha Schlüter, Stéphane Fourcade, Nathalie Launay, Javier Joya, Sergio Aguilera, María Eugenia Yoldi, Carlos Casasnovas, Mary Willis, Montserrat Ruíz, Dorothée Ville, Gaëtan Lesca, Karine Siquier-Pernet, Isabelle Desguerre, Huifang Yan, Jingmin Wang, Margit Burmeister, Lauren Brady, Mark A. Tarnopolsky, Carles Cornet, Davide Rubbini, Javier Terriente, Kiely N. James, Damir Musaev, Maha S. Zaki, Marc C. Patterson, Brendan C. Lanpher, Eric W. Klee, Filippo Pinto e Vairo, Elizabeth Wohler, Nara Sobreira, Julie S. Cohen, Reza Maroofian, Hamid Galehdari, Neda Mazaheri, Gholamreza Shariati, Laurence Colleaux, Diana Rodriguez, Joseph G. Gleeson, Cristina Pujades, Ali Fatemi, Odile Boespflug‐Tanguy, Aurora Pujol

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSphingolipid Metabolism and Signaling
Établissements canadiensMcMaster Children's Hospital
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Human Genome Research InstituteEuropean Regional Development FundAgència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de RecercaCanadian Institutes of Health ResearchU.S. NavyIntellectual and Developmental Disabilities Research CenterNational Institutes of HealthUniversité Paris DiderotMinisterio de Economía y CompetitividadFondation pour la Recherche MédicaleGeneralitat de CatalunyaBaylor-Hopkins Center for Mendelian GenomicsAgence Nationale de la RechercheInstituto de Salud Carlos IIINational Research FoundationNational Multiple Sclerosis SocietyFundación HesperiaCenter for Individualized Medicine, Mayo ClinicCentres de Recerca de CatalunyaOntario Genomics InstituteHoward Hughes Medical InstituteGeorgia Clinical and Translational Science AllianceSimons Foundation Autism Research InitiativeGénome QuébecMayo ClinicNational Ataxia FoundationOntario GenomicsU.S. Department of DefenseSimons FoundationGenome CanadaYale UniversityInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleJohns Hopkins UniversityMcGill UniversityEuropean CommissionBroad Institute
Mots-clésSphingolipidLeukodystrophyMyelinFingolimodBiologySpasticityEndoplasmic reticulumZebrafishNeuroscienceCeramideCell biologyMedicineInternal medicineGeneticsMultiple sclerosisImmunologyDiseaseGenePhysical medicine and rehabilitationCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sphingolipid imbalance is the culprit in a variety of neurological diseases, some affecting the myelin sheath. We have used whole-exome sequencing in patients with undetermined leukoencephalopathies to uncover the endoplasmic reticulum lipid desaturase DEGS1 as the causative gene in 19 patients from 13 unrelated families. Shared features among the cases include severe motor arrest, early nystagmus, dystonia, spasticity, and profound failure to thrive. MRI showed hypomyelination, thinning of the corpus callosum, and progressive thalamic and cerebellar atrophy, suggesting a critical role of DEGS1 in myelin development and maintenance. This enzyme converts dihydroceramide (DhCer) into ceramide (Cer) in the final step of the de novo biosynthesis pathway. We detected a marked increase of the substrate DhCer and DhCer/Cer ratios in patients' fibroblasts and muscle. Further, we used a knockdown approach for disease modeling in Danio rerio, followed by a preclinical test with the first-line treatment for multiple sclerosis, fingolimod (FTY720, Gilenya). The enzymatic inhibition of Cer synthase by fingolimod, 1 step prior to DEGS1 in the pathway, reduced the critical DhCer/Cer imbalance and the severe locomotor disability, increasing the number of myelinating oligodendrocytes in a zebrafish model. These proof-of-concept results pave the way to clinical translation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations106
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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