MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2909425558 · doi:10.1080/23802359.2018.1544864

The complete mitochondrial genome of the kelp fly <i>Fucellia costalis</i> (Diptera: Anthomyiidae) from Pacific Grove, California

2019· article· en· W2909425558 sur OpenAlexaboutno aff
Ivan D. Agudelo, Karina Almanza, Maria Guadalupe Altamirano Manriquez, Paulina Andrade, Eduardo Anguiano, S. Ayala, Dominic Barrios, Lyric Batistiana, Kruthi Battar, Daisy Noemi Benavides, R. Contreras Chávez, Yosselin Cuevas, Neovid C. Cuevas, Rogelio Garcia, Maria E. Diaz, Jamileth Figueroa, Martin Flores, Aaron Galvan, Yazmín Esperanza López García, Christian Gonzalez Balcazar, Gabriel Zárate Guerrero, Maiya R. Harper, T. García Hernández, Jeffrey Y. Honda, Jeffery R. Hughey, Victoria N. Hutchins, Raul Rodrigo Lazaro Olivera, Evelyn Macias Reyes, Isela M. Magallon, Adrian J. Maldonado, Dayana Maravillo Sanchez, Lauryn Martinez, Cristhian Mendoza, Antonio Gómez Mendoza, Jason Montoya, Prashant P. Naidu, Alexis Novoa, Natalie M. Ortega, David Ortíz, Anastacia M. Paredes, Eduardo Perez Solis, Abbey A. Plascencia, Alejandra N. Ponce, Alicia E. Ramirez, María F. Ramirez, Sergio Rodríguez, Angélica Gutiérrez-Sánchez, Nia N. Serrano, Francisco D. Solano, Daniel P. Soto, Alicia Steinhardt, Maria O. Taveras Dina, Alejandra L. Tong, Brenda J. Torresillas, Rolando T. Valdez, Paola Vidales Villicana, Adrian Zamora, Frances Wong

Notice bibliographique

RevueMitochondrial DNA Part B · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect behavior and control techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAnthomyiidaeBiologyPhylogenetic treeSubfamilyEvolutionary biologyKelpSyntenyGeneBotanyGenomeGeneticsPEST analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genomic analysis of the kelp fly Fucellia costalis (Family Anthomyiidae) from Asilomar beach, Pacific Grove, California, resulted in the assembly of its complete mitogenome. The mitogenome is 16,175 bp in length, A + T biased (78.1%), contains 37 genes, a large 1356 bp control region, and has a high-level of gene synteny to other Muscoidea. Phylogenetic analysis of F. costalis fully resolves it in a clade with two members of the Anthomyiidae, Delia platura (8.2% pairwise genetic distance) and D. antiqua (9.2% distance), in a sister position to Scathophaga stercoraria (7.8% distance) from the Scathophagidae. The phylogenetic position and genetic distances of F. costalis support the continued recognition of the subfamily Fucellinae. This identification and data extends the distributional range of F. costalis northward from California to Vancouver Island, Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,101

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMitochondrial DNA Part BMême sujetInsect behavior and control techniquesTravaux en français237 207