IL‐17R deletion predicts high‐grade colorectal cancer and poor clinical outcomes
Notice bibliographique
Résumé
The IL-17 receptor (IL-17R) has a perplexing role in cancer, which may be explained by its yin-yang signaling pathways. Recently, the critical role of IL-17R in maintaining basal levels of A20-a key negative regulator of NF-κB and JNK-c-Jun pathways has been demonstrated in cancer cell lines. Cross-cancer analyses of somatic copy number alterations in IL-17RA, IL-17RC and A20 genes reveal that IL-17RA-deletion is common in colorectal cancer (CRC) patients, representing 24, 26, 37 and 49% of stage I, II, III and IV of patients, respectively, and mutually exclusive with patients displaying microsatellite instability. Importantly, patients with IL-17R-deletion or concurrent deletions of A20 show significantly reduced overall survival. Analysis of multiple published microarray studies confirms that IL-17RA expression is significantly reduced in CRC samples compared to normal counterparts, and its level is closely associated with A20 expression. Analyses of RNAseq data indicate that tumors with IL-17R-deletion express strong molecular markers of tumor invasion, growth and metastasis. Notably, approximately 20 genes responsible for protein synthesis and mitochondrial metabolism are inversely correlated with both IL-17RA and A20. Immunohistochemistry staining in human colorectal tissue arrays further reveals that high-grade tumors have significantly reduced IL-17RA staining compared to low-grade tumors. Thus, collective evidence strongly supports a previously unrecognized CRC-promoting mechanism triggered by IL-17RA-deletion and highlights its utility as a prognostic marker in CRC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».