The Phase-Shifting Effect of Bright Light Exposure on Circadian Rhythmicity in the Human Transcriptome
Notice bibliographique
Résumé
Light is a potent synchronizer of the central circadian clock; however, the effect of light exposure on peripheral gene expression is largely unknown. The objective of this study was to explore the effect of bright light exposure on genome-wide peripheral gene expression levels during a 4-day simulated night shift protocol in which the habitual sleep period is delayed by 10 h. Eleven healthy participants (mean age, 24 years; range, 18-30; 10 men/1 woman) were studied under controlled laboratory conditions. Three participants were exposed to bright light (~6,500 lux) for 8 h during the nightly waking period, while the other 8 were maintained in dim-light conditions (~10 lux). At baseline and on the fourth day after the shift in the sleep period, blood samples were collected during two 24-h measurement periods. RNA was extracted from peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and used to obtain transcriptomic data. Using 2 independent approaches to determine phase shifts among rhythmically expressed genes after the shifted sleep schedule compared with baseline, we found that the average phase delay in the bright light group was approximately 8 to 9 h, whereas the average phase delay in the control group was approximately 1 to 2 h, both at the group level and at the individual level. In line with these findings, further analysis using partial least squares regression indicated that the peripheral circadian transcriptome of PBMCs was predictive of the phase of the central circadian pacemaker after only 3 days of bright light exposure. These results indicate that bright light exposure exerts a phase-shifting effect on the circadian transcriptome in PBMCs with a magnitude similar to its effect on the central circadian clock.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».