MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2911363089 · doi:10.1093/ecco-jcc/jjy222.294

P170 Diagnostic criteria for IBD subtype classification: a multi-centre validation cohort

2019· article· en· W2911363089 sur OpenAlexaff
Micol Sonnino, M Matar, Amit Assa, R Lev Zion, Eyal Shteyer, Anne M. Griffiths, Dan Turner, Oren Ledder

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineUlcerative colitisCohortInflammatory bowel diseaseInternal medicineRetrospective cohort studyPancolitisCrohn's diseaseGastroenterologyDiseaseColonoscopyColorectal cancerCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

IBD-unclassified (IBD-U) is a diagnosis on the spectrum between Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC) with very low agreement between physicians and a wide heterogeneity in the diagnosis rate of IBDU across sites. The PIBD-classes criteria were thus developed to standardise the classification of children with IBD as having CD, colonic CD, IBD-U, atypical UC and UC. We aimed to provide further validation of the PIBD-classes criteria on real-world data of paediatric IBD. Multi-centre retrospective longitudinal study of children (2–18 years) diagnosed with IBD with at least 1 year follow-up and available gastroscopy and ileocolonoscopy. Clinical, radiologic, endoscopic and histological data were recorded as well as the 23 items required for the PIBD-classes criteria, and revised diagnosis at last follow-up. In total, 184 children were included (age at diagnosis 13 ± 3 years, 55% males) of whom 122 (66%) were diagnosed by the clinician with CD, 17 (9%) with IBD-U and 45 (25%) with UC. By the PIBD-classes criteria, 121 (66%) had CD (of whom 5 (3% of the entire cohort) had colonic CD), 22 (12%) had IBDU and 41 (22%) UC (of whom 14 (8% of the entire cohort) had atypical UC). There was high agreement between clinician-assigned and PIBD-classes-generated classification for CD (93%; 8 patients moved to IBD-U) and for UC (84%; 6 moved to IBD-U and one to CD). Of the 17 children classified as IBD-U, 9 (53%) were re-classified by the PIBD-classes criteria: 2 as atypical UC, 1 as UC, and 6 as CD. The initial clinician’s diagnosis was revised at the last follow-up in 10 patients, five of whom supported the classification of the PIBD-classes (four IBD-U patients, two reclassified as CD, two reclassified as UC, 1 UC patient reclassified as IBD-U). The PIBD-classes algorithm is a useful, standardised tool to facilitate accurate classification of IBD subtypes and the average rate of the disease subtypes remain as the clinicians’ classification. In cases of change of IBD class during follow-up the PIBD-classes criteria accurately predicted the final allocation in half of patients. Application of the PIBD-classes algorithm should be considered to improve reliability and consistency of IBD subtype classification between physicians and centres.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Crohn s and Colitis→Même sujetInflammatory Bowel Disease→Travaux en français237 207→