Antimicrobial Resistance and Virulence Gene Profiles Among <i>Escherichia coli</i> Isolates from Retail Chicken Carcasses in Vietnam
Notice bibliographique
Résumé
This study evaluated virulence and resistance profiles of Escherichia coli in chicken carcasses from three retail systems in Vietnam. Fresh chicken carcasses from traditional markets and fresh and frozen chicken carcasses from supermarkets were sampled in Vietnam. E. coli isolates from carcass rinses were characterized for extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) virulence factors ( iucD , cnf , papC , tsh , KpsMT II , afa , and sfa ) and for phenotypical antimicrobial resistance by Sensititre ARIS ® as well as genotypically by polymerase chain reaction. An elevated proportion (30% to 70%) of samples resistant to antimicrobials critically important for human medicine was observed in routine isolates, with no significant differences between the three retail systems. Multidrug-resistant (MDR) ExPEC isolates of phylogroup B1 and, of greater concern, of phylogroup F were detected. Extended-spectrum β-lactamase (ESBL)- and AmpC β-lactamase-producing E. coli possessing bla CTX-M or bla CMY-2 resistance genes, respectively, were found. The presence of ExPEC with a high level of antimicrobial resistance (more than 50% of isolates) and MDR (91% of isolates) and detection of ESBL-producing E. coli underline the potential health threat for humans associated with mishandled chicken carcasses or consumption of undercooked chicken meat in Vietnam.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».