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Enregistrement W2911469917 · doi:10.1021/jacs.8b13049

Two-Enzyme Pathway Links <scp>l</scp>-Arginine to Nitric Oxide in <i>N</i>-Nitroso Biosynthesis

2019· article· en· W2911469917 sur OpenAlexafffund
Haiyan He, Alyssa C. Henderson, Yi‐Ling Du, Katherine S. Ryan

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePolyamine Metabolism and Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BCAlfred P. Sloan Foundation
Mots-clésChemistryNitric oxideNitrosoBiosynthesisArginineStreptozocinEnzymeArginaseBiochemistryNitric oxide synthaseNitroso CompoundsAmino acidOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nitric oxide (NO) has wide-ranging roles in biology, but less is known about its role in building chemical diversity. Here we report a new route to NO from the biosynthetic pathway to the N -nitroso compound streptozocin. We show that the N -nitroso group of streptozocin comes from the biosynthetic reassembly of l -arginine, with the guanidino nitrogens forming a nitrogen–nitrogen bond. To understand this biosynthetic process, we identify the biosynthetic gene cluster of streptozocin and demonstrate that free l -arginine is N -methylated by StzE to give N ω -monomethyl- l -arginine. We show that this product is then oxidized by StzF, a nonheme iron-dependent enzyme unrelated to known nitric oxide synthases, generating a urea compound and NO. Our work implies that formation and capture of NO is the likely route to N -nitroso formation in vivo. Altogether, our work unveils a new enzyme pair for the production of NO from l -arginine and sets the stage for understanding biosynthetic routes to N -nitroso natural products.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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