Taxonomy and biogeography of <i>Agarum</i> and <i>Thalassiophyllum</i> (Laminariales, Phaeophyceae) based on sequences of nuclear, mitochondrial, and plastid markers
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Agarum is a perennial kelp genus that has a broad distribution from the northwest Pacific to the northwest Atlantic Ocean. In order to address questions regarding phylogenetic relationships and present‐day distribution patterns of species within this genus, we analyzed the nuclear ITS2, mitochondrial cox1 and cox3, and plastid RuBisCO spacer from a subset of 130 samples of the genus plus Thalassiophyllum and Costaria. All analyses of the individual markers and the ITS2 + cox1 + cox3 dataset consistently produced a clade of Agarum that included Thalassiophyllum . The clade consisted of two well‐resolved subclades: one composed of A. fimbriatum and A. oharaense, and the other of A. clathratum , A. turneri , A. yakishiriense , and T. clathrus (the type of the generic name Thalassiophyllum ). On the basis of these results, we treat Thalassiophyllum as a syn onym of Agarum , reinstating the combination A. clathrus made by Greville in 1830. Despite its wide distribution from Japan through Alaska to the east coast of North America, A. clathratum had low genetic diversity, suggesting a relatively recent long‐distance dispersal of the species. The low degree of substitutions between A. clathratum and A. yakishiriense suggests their recent divergence from a common ancestor, and we recognize the latter as a subspecies of the former. Because type ma terial of A. clathratum has not been found, we designate as neotype a specimen collected in Kamchatka, one of two syntype localities cited by Gmelin for Fucus agarum.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».