MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2912460931 · doi:10.5287/ora-b7axkrdnj

The role of hypoxia-induced RRM2B in DNA replication

2016· dissertation· en· W2912460931 sur OpenAlexfundno aff
Iosifina P. Foskolou

Notice bibliographique

RevueOxford University Research Archive (ORA) (University of Oxford) · 2016
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBC Cancer AgencyMedical Research CouncilEuropean CommissionUniversity of OxfordKing's College LondonCancer Research UK
Mots-clésReplication (statistics)DNA replicationCell biologyHypoxia (environmental)DNAChemistryBiologyGeneticsVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Regions of low oxygen (hypoxia) occur in most solid tumours and correlate with poor patient prognosis due to their resistance to chemo- and radiotherapy and to their increased metastatic potential. Severe levels of hypoxia induce DNA replication stress characterised by an increased number of stalled replication forks and significantly reduced replication rates, which occurs in the absence of DNA damage. Ribonucleotide Reductase (RNR) is the only enzyme capable of de novo synthesis of dNTPs – the building blocks of DNA synthesis and repair. However, oxygen is essential for mammalian RNRs (RRM1/RRM2 and RRM1/RRM2B), leading us to question the source of dNTPs in hypoxia. Here we show that the RRM2B subunit of RNR is significantly induced in response to hypoxia in a universal manner. Interestingly, the hypoxic induction of RRM2B occurs both at transcriptional and translational levels and likely through two distinct mechanisms, one of which is p53-dependent. Most importantly, we demonstrate that RRM1/RRM2B enzyme is capable of retaining activity in hypoxia and therefore is favoured over RRM1/RRM2 in order to preserve on-going replication. We found two distinct mechanisms by which RRM2B maintains hypoxic activity and we identified specific RRM2B-residues (Y164 and K37/K151) responsible for this function. The importance of RRM2B in the response to tumour hypoxia is further illustrated by increased expression in the hypoxic regions of glioblastoma biopsies, roles in tumour growth and radioresistance, as well as prevention of DNA damage and apoptosis. In this study we present multi-disciplinary evidence, demonstrating the molecular rationale for the ability of RRM1/RRM2B to function in hypoxia. We propose that RRM2B has been evolutionary conserved so as to act as the hypoxic specific RNR subunit in order to be able to react promptly when this physiologically relevant stress occurs. Our data provide new insight into RNR biology, highlighting RRM2B as an important, hypoxic-specific, anti-cancer therapeutic target.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOxford University Research Archive (ORA) (University of Oxford)→Même sujetMitochondrial Function and Pathology→Travaux en français237 207→