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Enregistrement W2913408183 · doi:10.1107/s010876731809863x

Cfp1/Cps40 stabilizes MLL complex formation through multi-valent interactions

2018· article· en· W2913408183 sur OpenAlexaff
Yidai Yang, Monika Joshi, Jean‐François Couture

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCrystallographyMaterials scienceChemistryBiophysicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The SET1 family of methyltransferases (SET1A/B, MLL1-4) are responsible for the methylation of Lys-4 on histone H3 (H3K4), a post-translational modification that is predominantly localized in the promoter and enhancer regions of actively transcribed genes. Moreover, mis-regulation or mutations of members of SET1 family of PKMTs is now recognized as a hallmark of cancers. Members of the SET1 family of methyltransferases require several regulatory subunits to efficiently methylate histone H3. These subunits include DPY30/Cps25, WDR82/Cps30, WDR5/Cps35, Cfp1/Cps40, RbBP5/Cps50 and Ash2L/Cps60. Once bound to SET1, these proteins form a protein complex referred to as COMPlex ASsociated to SET1 (COMPASS) whose role is to fully activate the methyltransferase activity of SET1. While previous structural studies highlighted important molecular underpinnings underlying the interaction of COMPASS subunits 1-3 , they failed to capture the overall architecture of COMPASS. In addition, owing to the low resolution of a Cryo-EM structure of COMPASS 4 , an in-depth understanding of the structural determinants controlling the formation and regulation of COMPASS remains elusive.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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