<i>Saccharomyces cerevisiae</i> strains display robust phenotypes in the presence of Dyskeratosis congenita mutations in the <i>Cbf5</i> gene
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Dyskeratosis congenita is a rare, congenital disorder affecting the skin, nails and oral mucosa of patients that often progresses to bone marrow failure and an increased predisposition for a variety of carcinomas. Mutations in the human dyskerin gene have been identified as the most prevalent cause of the disease. Dyskerin is a pseudouridine synthase and the catalytic subunit of H/ACA ribonucleoproteins (RNPs) responsible for the modification of uridines to pseudouridine in ribosomal RNA (rRNA), but dyskerin also binds to the telomerase RNA component (TERC). Accordingly, Dyskeratosis congenita mutations have been reported to affect both telomerase function as well as ribosome biogenesis, but the relative contribution of each pathway to the diseases is under debate. As the yeast homolog of dyskerin, Cbf5, does not interact with telomerase RNA, Saccharomyces cerevisiae is an ideal model to identify the selective impact of Dyskeratosis congenita mutations on ribosome biogenesis. Therefore, chromosomal mutations in the yeast homologue of dyskerin, Cbf5, were introduced at positions corresponding to the mutations in human dyskerin that result in Dyskeratosis congenita. To determine if the mutations affect cellular fitness, we screened for growth defects in yeast. Growth curves at different temperatures and yeast spot assays under several stress conditions revealed that the mutations in cbf5 did not impair growth compared to wild type. These findings suggest that in the yeast cell, Dyskeratosis congenita mutations do not significantly affect ribosome biogenesis, and we discuss the implications for understanding the molecular cause of Dyskeratosis congenita.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».