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Enregistrement W2914410118 · doi:10.1109/jbhi.2018.2865450

Convolutional Neural Network With Shape Prior Applied to Cardiac MRI Segmentation

2018· article· en· W2914410118 sur OpenAlexaff
Clément Zotti, Zhiming Luo, Alain Lalande, Pierre‐Marc Jodoin

Notice bibliographique

RevueIEEE Journal of Biomedical and Health Informatics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMedical Image Segmentation Techniques
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceSegmentationConvolutional neural networkSørensen–Dice coefficientArtificial intelligenceVentricleEndocardiumMagnetic resonance imagingCardiac magnetic resonance imagingDeep learningHausdorff distancePattern recognition (psychology)Image segmentationComputer visionMedicineRadiologyCardiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this paper, we present a novel convolutional neural network architecture to segment images from a series of short-axis cardiac magnetic resonance slices (CMRI). The proposed model is an extension of the U-net that embeds a cardiac shape prior and involves a loss function tailored to the cardiac anatomy. Since the shape prior is computed offline only once, the execution of our model is not limited by its calculation. Our system takes as input raw magnetic resonance images, requires no manual preprocessing or image cropping and is trained to segment the endocardium and epicardium of the left ventricle, the endocardium of the right ventricle, as well as the center of the left ventricle. With its multiresolution grid architecture, the network learns both high and low-level features useful to register the shape prior as well as accurately localize the borders of the cardiac regions. Experimental results obtained on the Automatic Cardiac Diagnostic Challenge - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (ACDC-MICCAI) 2017 dataset show that our model segments multislices CMRI (left and right ventricle contours) in 0.18 s with an average Dice coefficient of [Formula: see text] and an average 3-D Hausdorff distance of [Formula: see text] mm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations209
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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