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Enregistrement W2914410596 · doi:10.1107/s0108767318097155

Overexpression, purification of GSK3β and its interaction with an inhibitory fragment of the psychiatric risk protein DISC1

2018· article· en· W2914410596 sur OpenAlexafffund
Narsimha Pujari, Stephanie Saundh, Steve Gagné, Sean Lipsit, Adelaine Kwun-Wai Leung

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhosphodiesterase function and regulation
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSaskatchewan Health Research Foundation
Mots-clésFragment (logic)Inhibitory postsynaptic potentialDISC1PsychiatryChemistryMedicineInternal medicineBiochemistryGeneComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Disrupted in Schizophrenia 1(DISC1) is a candidate risk gene in a number of major mental illnesses, e.g. depression, bipolar disorder and schizophrenia. DISC1 is a scaffold protein that interacts with a myriad of proteins, forming a large protein-protein-interaction network that coordinates various stages of brain development. Our lab is interested to understand how the structure of DISC1 facilitates its function in brain development. One of DISC1's interactors is the enzyme glycogen synthase kinase 3 (GSK-3). As a target for lithium, GSK3 is itself implicated in bipolar disorder. Through physical interactions, DISC1 inhibits GSK3 's function in the canonical Wnt/-catenin signalling pathway, which controls the proliferation of neural progenitors. The full length DISC1 protein is composed of 854 amino acids. The most potent GSK3 inhibitory region has been mapped to a short region in the N-terminus (residue 195-238). This 44 amino acid region (DISC1-44mer) can inhibit and bind GSK3 in in vitro experiments. To understand the mechanism of how DISC1 inhibits GSK3 , we are pursuing structural studies of GSK3 in complex with different truncations of DISC1. We will present our progress towards the structural studies of this important complex that is relevant to the pathophysiology of psychiatric diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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