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Enregistrement W2914417447 · doi:10.1073/pnas.1817376116

Paneth cell α-defensins HD-5 and HD-6 display differential degradation into active antimicrobial fragments

2019· article· en· W2914417447 sur OpenAlexafffund
Dirk Ehmann, Judith Wendler, Louis Koeninger, Ida Larsen, Thomas Klag, J. Berger, André Marette, Martin Schaller, Eduard F. Stange, Nisar P. Malek, Benjamin A. H. Jensen, Jan Wehkamp

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université LavalNovo Nordisk FondenNovo NordiskH. Lundbeck A/SLundbeckfondenUniversité LavalDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean Commission
Mots-clésAntimicrobialAntimicrobial peptidesPaneth cellDegradation (telecommunications)Differential (mechanical device)ChemistryDefensinMicrobiologyCell biologyBiologyBiochemistryPhysicsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Paneth cells provide intestinal host defense against pathogens and control the healthy microbiota by secreting antimicrobial peptides. We show that the most abundant secreted Paneth cell products, human defensin HD-5 and HD-6, show a distinct susceptibility to proteolytic digestion by human duodenal fluid. While HD-5 is digested in many fragments, HD-6 is stable and still able to form nanonets. The occurring fragments of HD-5 were antimicrobially active against microorganisms. We provide proof of concept about microbiome modulating capacities in vivo, which includes an increase of Akkermansia sp. Our results indicate that fragmentation of defensins increases antimicrobial diversity and further adds to the complexity of host microbial interaction at interfaces. Fragmentation could lead to new antimicrobial peptides with possible therapeutic usage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,336

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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