A virus‐induced gene‐silencing system for functional genetics in a betalainic species, <i>Amaranthus tricolor</i> (Amaranthaceae)
Notice bibliographique
Résumé
Premise of the Study Research in Amaranthaceae could be accelerated by developing methods for targeted gene silencing. Most amaranths, including Amaranthus tricolor, produce betalains. However, the physiological and ecological roles of these pigments are uncertain. We sought to establish a virus‐induced gene‐silencing (VIGS) method for amaranths, using silencing of betalain pigments as a proof‐of‐principle. Methods We targeted AtriCYP76AD1, a putative cytochrome P450 component of the betalain biosynthetic pathway, using VIGS, and compared two different methods of introducing the VIGS construct into plants. We measured transcript abundance and concentrations of betalains and their l‐DOPA precursor in VIGS‐treated plants, and compared these to controls. Results We observed that when AtriCYP76AD1 was targeted by VIGS in normally red plants, AtriCYP76AD1 and the related genes AtriCYP76AD6 and AtriCYP76AD5 had diminished transcript abundance. Furthermore, newly emergent petioles and leaves of VIGS‐treated plants appeared green, betacyanin accumulation was strongly reduced, and l‐DOPA accumulation was increased. No betaxanthin could be detected in this variety of A. tricolor, either before or after VIGS treatment. Discussion These results help to establish the genetic basis of betalain synthesis in amaranths. Furthermore, this is the first report of VIGS in amaranths and demonstrates the potential of this technique for basic and applied research in these species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».