Association of the TLR1 variant rs5743557 with susceptibility to tuberculosis
Notice bibliographique
Résumé
Background: Toll-like receptor 1 (TLR1) and TLR6 play important roles in the innate immune response against Mycobacterium tuberculosis (M.TB) via interactions with TIR domain-containing adaptor protein (TIRAP) and myeloid differentiation primary response 88 (MYD88). The aim of this study was to investigate the relationship of TLR1, TLR6, MYD88 and TIRAP polymorphisms with susceptibility to latent tuberculosis infection (LTBI) and tuberculosis (TB). Methods: In total, 204 uninfected healthy controls (HC), 201 individuals with LTBI and 209 TB patients were enrolled. Two interferon-γ release assays were used to differentiate individuals with LTBI from uninfected controls. TagSNPs of the four genes were genotyped by the SNPscanTM Kit. The Haploview 4.2 and SHEsis software packages were combined to perform linkage disequilibrium (LD) and haplotype analyses. Multifactor dimensionality reduction (MDR) software was used to investigate gene-gene interaction. The Stata 12.0 software was used to perform meta-analysis of the relationship between rs5743557 and TB susceptibility. Results: The AA genotype of rs5743557 was associated with reduced TB risk (P=0.006) and the AA/GA genotypes of TLR1 rs5743604 were associated with increased TB risk (P=0.017) when the LTBI group was compared with the TB group. The frequency of TLR1 haplotype rs4833095-rs5743604 CG was significantly higher in the LTBI group than in the TB group (P=0.019877). However, only the relationship between rs5743557 and TB susceptibility remained significant after 1000-fold permutation testing (P=0.023). The meta-analysis suggested that rs5743557_A was associated with decreased TB risk in the Chinese adult population (P<0.001, OR 0.80, 95% CI: 0.72–0.88). No significant gene-gene interactions were found. Conclusions: The results of our study suggest that the tagSNP rs5743557 of TLR1 is associated with the risk of TB.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».