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Enregistrement W2915771614 · doi:10.1097/pai.0000000000000734

Diagnostic Accuracy in Fit-for-Purpose PD-L1 Testing

2019· article· en· W2915771614 sur OpenAlexaffabout
Carol C. Cheung, Hyun J. Lim, J. R. Garratt, Jennifer Won, C. Blake Gilks, Emina Torlakovic

Notice bibliographique

RevueApplied immunohistochemistry & molecular morphology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanSaskatchewan Health AuthorityVancouver General HospitalUniversity Health NetworkUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGold standard (test)Quality assuranceMedicineDiagnostic testMedical physicsTonsilDiagnostic accuracyExternal quality assessmentComputer sciencePathologyInternal medicineEmergency medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PD-L1 testing by immunohistochemistry (IHC) has presented significant challenges not only for clinical laboratories, but also for external quality assurance (EQA) entities that provide proficiency testing (PT) for clinical laboratories. Canadian Immunohistochemistry Quality Control (CIQC) has used educational runs to explore approaches to sample design and analysis of results that would enhance patient safety. As PT for predictive biomarkers requires modeling at every level (design of the run, assessment of the run, and reporting of "pass" or "fail") based on "fit-for-purpose" principles, CIQC has applied those principles to PD-L1 PT runs. Each laboratory received unstained slides with TMA tissue cores from 104 randomly selected primary NSCLC and tonsil tissues to test with their current PD-L1 assay. Diagnostic sensitivity and specificity were calculated against designated gold standards based on the "3D" approach (drug-disease-diagnostic assay). Depending on the selection of fit-for-purpose gold standards and also on the selection of what was considered fit-for-purpose cut-off points, great variation in the performance (accuracy) of both companion/complementary diagnostic assays and laboratory developed tests was seen. "Fit-for-purpose" in PT for PD-L1 testing entails that the purpose(s) of each PT run is declared a priori, that the PT program has selected/designated purpose-specific gold standard results for the PT challenge, and that the PT materials for the PT run are designed and constructed to enable calculations of diagnostic accuracy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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